More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3117 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
420 aa  831    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  74.6 
 
 
700 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  59.75 
 
 
696 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  59.08 
 
 
703 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  46.09 
 
 
384 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  48.69 
 
 
397 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  45.43 
 
 
681 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  44.92 
 
 
669 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  46.91 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  44.33 
 
 
390 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  42.78 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
403 aa  189  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 
405 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 
412 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 
405 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.4 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  28.88 
 
 
372 aa  67  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 
368 aa  67  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 
352 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  34.69 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.1 
 
 
353 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 
429 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 
342 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.57 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
341 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  32.59 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 
470 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 
355 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  34.81 
 
 
350 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 
360 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
354 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  22.54 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 
485 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  21.75 
 
 
363 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
467 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  21.84 
 
 
331 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 
326 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 
355 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  31.48 
 
 
462 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  29.17 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  26.6 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
425 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
353 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.28 
 
 
334 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
435 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  24.45 
 
 
371 aa  57  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 
366 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 
344 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  29.45 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.43 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  30.34 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
484 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
483 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.38 
 
 
343 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  28.77 
 
 
368 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.38 
 
 
343 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  32.68 
 
 
338 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  31.33 
 
 
337 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.81 
 
 
313 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  26.49 
 
 
340 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  25.3 
 
 
356 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  21.98 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
444 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.43 
 
 
343 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 
353 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>