More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 403 aa  793    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  43.86 
 
 		 669 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  45.96 
 
 		 703 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  45.65 
 
 		 696 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  42.78 
 
 		 420 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  40.43 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  41.76 
 
 		 681 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  41.73 
 
 		 700 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  43.42 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  39.52 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  40.68 
 
 		 397 aa  219  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.63 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30.7 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  27.9 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  24.36 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  29.53 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.52 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.57 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  34.55 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  23.89 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.21 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  27.43 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  27.43 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  27.43 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  37.5 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  39 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  40 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  33.59 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  36.08 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  37.65 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  34.94 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  25.69 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  21.02 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  37.62 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  38.64 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  23.91 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  31.51 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.54 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  28.88 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  35.63 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  37.21 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  36.25 
 
 		 478 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  26.67 
 
 		 346 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  37.04 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  25.53 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  32.04 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  35.42 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  25.35 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  32.38 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  34.52 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  33.94 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 326 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>