More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0593 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 383 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  50.94 
 
 		 384 aa  336  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  51.72 
 
 		 681 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  49.73 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  48.07 
 
 		 700 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  48.29 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  49.87 
 
 		 703 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  47.78 
 
 		 696 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  43.85 
 
 		 669 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  43.42 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  40.9 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.92 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.24 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  33.47 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  29.19 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.7 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  27.78 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.65 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  29.63 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  23.49 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  29.08 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  33.49 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  35.43 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  21.66 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  21.4 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  36.59 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.57 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  32.95 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  21.98 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  30.11 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.54 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  38.05 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  27.54 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  41.67 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  37.76 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.54 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  37.69 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  24.61 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  23.47 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  50 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  34.56 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.1 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 449 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>