13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5678 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5678  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.814223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0431  hypothetical protein  54.17 
 
 		 341 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2201  hypothetical protein  47.46 
 
 		 348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2979  hypothetical protein  25.77 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4107  hypothetical protein  23.83 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.66 
 
 		 1286 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  22.02 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  24.68 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  24.01 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  25.38 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  28.46 
 
 		 681 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  21.39 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6423  hypothetical protein  23.93 
 
 		 416 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00773435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>