261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0302 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
464 aa  931    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  39.33 
 
 
421 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  39.11 
 
 
421 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  39.56 
 
 
416 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  37.89 
 
 
421 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  38.96 
 
 
420 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  40.49 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  37.97 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  45.32 
 
 
414 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  43.31 
 
 
414 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  35.81 
 
 
478 aa  269  8.999999999999999e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  33.11 
 
 
416 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  29.98 
 
 
440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02866  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11840)  26.9 
 
 
559 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 
699 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  23.3 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  26.17 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  24.94 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  24.76 
 
 
390 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
470 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
350 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  22.27 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  23.18 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
350 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
345 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 
383 aa  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
375 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
341 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
397 aa  63.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  26.86 
 
 
495 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  26.39 
 
 
493 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  22.96 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 
342 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
373 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  28.19 
 
 
345 aa  60.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 
335 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 
350 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  22.94 
 
 
496 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27.78 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  22.41 
 
 
431 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  25.6 
 
 
474 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
341 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  22.27 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  22.72 
 
 
390 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 
345 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  22.97 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
349 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  27.41 
 
 
347 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
345 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  34.59 
 
 
352 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  22.52 
 
 
328 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
341 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
359 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 
344 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 
428 aa  57.4  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
347 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.42 
 
 
450 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
381 aa  57.4  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  21.72 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 
350 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
399 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 
329 aa  56.6  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.84 
 
 
377 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  28.57 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  22.17 
 
 
313 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  24.26 
 
 
379 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.67 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
342 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 
345 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  28.43 
 
 
352 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 
400 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 
367 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  27.44 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  27.27 
 
 
338 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
396 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  23.98 
 
 
337 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  21.61 
 
 
372 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  21.61 
 
 
372 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.17 
 
 
312 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  23.08 
 
 
350 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 
389 aa  54.3  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 
337 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  23.47 
 
 
337 aa  53.9  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>