More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3234 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3234  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 367 aa  758    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00108627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  28.03 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  27.3 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 403 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  29.62 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.14 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  28.92 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  28.92 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  28.92 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  28.92 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  29.45 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  29.51 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  29.45 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  29.45 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  29.45 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  28.92 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  29.45 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  29.45 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0838  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.65 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  25.23 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  27.41 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  26.11 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.73 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  26.89 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.62 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.35 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  24.61 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.32 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  22.67 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  24.34 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26.28 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  27.49 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00860  conserved hypothetical protein  24.4 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0324614  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  27.18 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  26.69 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.08 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.17 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  25.44 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  24.75 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  21.9 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  25.56 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  23.79 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.74 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  28.49 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.35 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  25.91 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>