More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1260 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1260  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  743    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  76.84 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 374 aa  165  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  33.6 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  33.95 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  31.28 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  25.79 
 
 		 378 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 		 372 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  33.69 
 
 		 386 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  32.35 
 
 		 419 aa  145  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  35.55 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.69 
 
 		 369 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 398 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32.27 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  30.79 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  33.22 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  30.31 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 		 388 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  32.55 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  32.55 
 
 		 371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  32.22 
 
 		 413 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  30.51 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  31.79 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  31.52 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  32.1 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  30.39 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 		 398 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  31.51 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  32.25 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  29.96 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  28.99 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.99 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.21 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 370 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  30.18 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29.4 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  31.73 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 334 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>