More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6919 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  100 
 
 
312 aa  613  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  62.94 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  53.67 
 
 
315 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  53.67 
 
 
315 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  53.67 
 
 
315 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  53.9 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 
331 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 
315 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 
334 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 
334 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 
334 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 
334 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  53.57 
 
 
315 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  53.57 
 
 
315 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  53.57 
 
 
315 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.38 
 
 
463 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.41 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  49.52 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  51.77 
 
 
315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
321 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  56.77 
 
 
321 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
313 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  52.92 
 
 
314 aa  309  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  56.96 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  59.61 
 
 
307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  52.1 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  51.77 
 
 
321 aa  301  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
316 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
323 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  51.13 
 
 
317 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  50.48 
 
 
320 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  53.7 
 
 
320 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  52.06 
 
 
320 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  56.13 
 
 
305 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  50.65 
 
 
317 aa  292  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  51.13 
 
 
321 aa  291  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  50.97 
 
 
316 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  50.96 
 
 
321 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
318 aa  289  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  50.79 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  52.63 
 
 
315 aa  288  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  50.16 
 
 
316 aa  288  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  50.97 
 
 
316 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
315 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  49.18 
 
 
323 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  48.89 
 
 
322 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  47.92 
 
 
315 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  47.91 
 
 
325 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  47.92 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  48.09 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  48.39 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  45.16 
 
 
311 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  46.44 
 
 
338 aa  264  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  50 
 
 
318 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  45.71 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  45.66 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  46.6 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  45.09 
 
 
342 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  45.98 
 
 
317 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  44.37 
 
 
314 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  44.23 
 
 
315 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  47.39 
 
 
318 aa  239  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.54 
 
 
335 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  44.14 
 
 
344 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
341 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
325 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
332 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.98 
 
 
336 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  40.88 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.06 
 
 
343 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  44.67 
 
 
309 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.99 
 
 
343 aa  192  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  42.38 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  39.32 
 
 
331 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
327 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
343 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.75 
 
 
331 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
313 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
333 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
346 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
345 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
343 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  41.29 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.7 
 
 
331 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  38.27 
 
 
324 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  37.35 
 
 
361 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  39.14 
 
 
349 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
325 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  41.51 
 
 
323 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3284  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
319 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
343 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
352 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  43.69 
 
 
323 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
317 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  37.17 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0823  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  38.94 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>