More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2964 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  100 
 
 		 321 aa  653    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  94.39 
 
 		 321 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  71.96 
 
 		 321 aa  481  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  72.73 
 
 		 320 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  72.15 
 
 		 317 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  66.67 
 
 		 322 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  64.22 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  62.5 
 
 		 326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  64.65 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  64.56 
 
 		 316 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  64.56 
 
 		 316 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  63.14 
 
 		 315 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  63.78 
 
 		 313 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  62.1 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  61.54 
 
 		 316 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  61.78 
 
 		 314 aa  391  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  63.87 
 
 		 323 aa  388  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  61.98 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  61.54 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.94 
 
 		 315 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  58.6 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.94 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.3 
 
 		 315 aa  371  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  61.22 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  59.74 
 
 		 320 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.94 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.94 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.62 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.94 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.94 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  61.34 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  61.66 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  57.14 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  61.66 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  61.98 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  61.66 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  58.18 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  61.66 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  59.74 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  61.02 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  57.51 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  58.2 
 
 		 314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  55.77 
 
 		 315 aa  348  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  55.45 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  53.53 
 
 		 315 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  52.24 
 
 		 315 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  51.91 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  52.56 
 
 		 316 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  53.04 
 
 		 314 aa  311  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  51.92 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  51.99 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  52.88 
 
 		 321 aa  298  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  51.77 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  50.96 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  45.71 
 
 		 338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  51.28 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  53.11 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  44.65 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  43.56 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  44.83 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  46.58 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  47.57 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  46.01 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  45.7 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.42 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.48 
 
 		 333 aa  211  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  42.54 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  40.32 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  38.51 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  39.54 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.44 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.51 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.01 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  38.7 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  39.45 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  37.96 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  37.34 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  37.96 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  38.1 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  37.8 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  39.03 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  38.08 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  39.03 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  39.93 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  39.5 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  36.65 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  40.92 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  37.23 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  37.77 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  38.71 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  40.57 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.08 
 
 		 344 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  38.36 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  37.06 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  39.27 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>