More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2213 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  100 
 
 		 322 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  72.41 
 
 		 325 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  72.06 
 
 		 326 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  67.41 
 
 		 317 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  66.67 
 
 		 321 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  66.46 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  66.35 
 
 		 321 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  64.01 
 
 		 320 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  65.71 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  62.74 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  64.65 
 
 		 323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  62.82 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  62.1 
 
 		 316 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  65.18 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  64.01 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  65.5 
 
 		 316 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  63.26 
 
 		 317 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  63.17 
 
 		 313 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  62.34 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  60.63 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  61.22 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  62.22 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  60.95 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.49 
 
 		 315 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  62.1 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.49 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.49 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.17 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.49 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.49 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.49 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.86 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  58.92 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  59.94 
 
 		 315 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  60.82 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  60.63 
 
 		 315 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  60.95 
 
 		 315 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  60.63 
 
 		 315 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  60.63 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  59.11 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  57.73 
 
 		 317 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  60.19 
 
 		 315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  60.19 
 
 		 315 aa  361  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  60.19 
 
 		 315 aa  361  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  55.56 
 
 		 316 aa  348  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 315 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  54.14 
 
 		 315 aa  341  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  53.21 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  55.37 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  51.43 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  51.12 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  52.53 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  50.79 
 
 		 321 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  47.69 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  52.58 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  48.89 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  46.77 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  48.6 
 
 		 323 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  52.75 
 
 		 307 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  49.52 
 
 		 305 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  50.18 
 
 		 318 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.6 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  45.22 
 
 		 329 aa  261  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  45.81 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  42.24 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  41.1 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.95 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.5 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.8 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  41.94 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  42.21 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.2 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.43 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  39.39 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  40.68 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  38.72 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1279  aldo/keto reductase  37.81 
 
 		 339 aa  206  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0530409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  41.46 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  41.03 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  42.38 
 
 		 352 aa  205  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  39.68 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  40.48 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  40.48 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.82 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  39.09 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1837  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  39.25 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  39.64 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  39.64 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  38.89 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  37.54 
 
 		 336 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  38.79 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2120  aldo/keto reductase  39.76 
 
 		 330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1969  putative oxidoreductase  38.33 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365702  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  41.27 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  38.04 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  38.56 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1755  aldo/keto reductase  39.76 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>