More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1279 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1279  aldo/keto reductase  100 
 
 
339 aa  700    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0530409  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0119  aldo/keto reductase  66.37 
 
 
339 aa  488  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1354  aldo/keto reductase  51.33 
 
 
338 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0700242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1363  aldo/keto reductase  51.33 
 
 
338 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197113  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  43.38 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  42.82 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1541  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
346 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.941337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5010  aldo/keto reductase  41.41 
 
 
345 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.714816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1120  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00427173  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.78 
 
 
350 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1222  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.78 
 
 
350 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1707  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.78 
 
 
350 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0364  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.78 
 
 
350 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0797  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.78 
 
 
350 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1836  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.78 
 
 
350 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1849  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.78 
 
 
350 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.5 
 
 
350 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1649  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
350 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456343  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4535  aldo/keto reductase  41.13 
 
 
346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1316  aldo/keto reductase  40.5 
 
 
352 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1565  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
350 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5006  putative oxidoreductase  40.11 
 
 
345 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.56 
 
 
346 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428097  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  41.38 
 
 
344 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1212  aldo/keto reductase  40.56 
 
 
352 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4410  aldo/keto reductase  40.28 
 
 
346 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.332653  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2669  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
345 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.634348 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1484  aldo/keto reductase  40.34 
 
 
350 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4794  aldo/keto reductase  40.5 
 
 
358 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57600  putative oxidoreductase  40.11 
 
 
345 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.855997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1108  aldo/keto reductase  39.78 
 
 
350 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  40.34 
 
 
350 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1588  aldo/keto reductase  39.78 
 
 
350 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1504  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
350 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1257  aldo/keto reductase  39.11 
 
 
345 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3126  aldo/keto reductase  39.66 
 
 
348 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  36.75 
 
 
346 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4726  aldo/keto reductase  39.49 
 
 
350 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0199  aldo/keto reductase family oxidoreductase TAS  40.8 
 
 
352 aa  260  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0900  aldo/keto reductase  40.97 
 
 
345 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.933192  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0921  aldo/keto reductase  39.72 
 
 
346 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  40.52 
 
 
344 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1638  aldo/keto reductase  39.49 
 
 
350 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.336172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
343 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2296  aldo/keto reductase  40.97 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209933  decreased coverage  0.0000407872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4695  aldo/keto reductase  38.87 
 
 
346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182273  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2478  oxidoreductase  38.64 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2569  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133654  normal  0.0183091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2776  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.86 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3496  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.496722  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3379  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3565  aldo/keto reductase  38.03 
 
 
346 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.556648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2284  aldo/keto reductase  39.2 
 
 
346 aa  252  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22370  Aldo/keto reductase  38.87 
 
 
346 aa  252  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0900  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.31 
 
 
346 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3686  aldo/keto reductase  38.03 
 
 
346 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0158243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0747  aldo/keto reductase  38.59 
 
 
346 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2491  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.11 
 
 
345 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3243  aldo/keto reductase  39.54 
 
 
344 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0830  aldo/keto reductase  40.95 
 
 
345 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1648  aldo/keto reductase  40.11 
 
 
350 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3664  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
349 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.160957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3273  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
346 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2245  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
353 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0753  aldo/keto reductase  38.03 
 
 
346 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0608854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2624  putative oxidoreductase  39.15 
 
 
347 aa  249  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.7862  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2755  aldo/keto reductase  39.11 
 
 
353 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1125  aldo/keto reductase  40.51 
 
 
351 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0848  aldo/keto reductase  37.75 
 
 
346 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.509349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2588  aldo/keto reductase  40.29 
 
 
352 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0754  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
346 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3180  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
346 aa  245  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1391  aldo/keto reductase  39.03 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  38.59 
 
 
346 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0736  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
346 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1031  putative aldo-keto reductase  37.75 
 
 
346 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0194633  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3243  putative aldo-keto reductase  37.75 
 
 
346 aa  241  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000690689  normal  0.0202789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0979  putative aldo-keto reductase  37.75 
 
 
346 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000256881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3221  putative aldo-keto reductase  38.59 
 
 
346 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  hitchhiker  0.000238185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0860  aldo/keto reductase  36.49 
 
 
347 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3173  putative aldo-keto reductase  38.59 
 
 
346 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.981924  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3155  putative aldo-keto reductase  38.59 
 
 
346 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0659763  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  39.11 
 
 
346 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3336  putative aldo-keto reductase  38.59 
 
 
346 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  0.0101445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3236  putative aldo-keto reductase  38.59 
 
 
346 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0896684  hitchhiker  0.000000643826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2697  aldo/keto reductase  38.78 
 
 
354 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1849  aldo/keto reductase  37.19 
 
 
353 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1076  aldo/keto reductase  38.76 
 
 
372 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.637292  normal  0.6452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1592  aldo/keto reductase  39.04 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  37.57 
 
 
353 aa  238  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0511  aldo/keto reductase  39.11 
 
 
356 aa  238  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1055  aldo/keto reductase  38.78 
 
 
347 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0855  aldo/keto reductase  37.01 
 
 
347 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3022  putative aldo-keto reductase  38.03 
 
 
346 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0156973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3275  putative aldo-keto reductase  36.62 
 
 
346 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3476  aldo/keto reductase  39.04 
 
 
353 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.293205 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  37.75 
 
 
346 aa  235  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  37.75 
 
 
346 aa  235  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42255  predicted protein  38.9 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>