More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2588 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2588  aldo/keto reductase  100 
 
 		 352 aa  711    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1592  aldo/keto reductase  70.9 
 
 		 354 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1076  aldo/keto reductase  71.59 
 
 		 372 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.637292  normal  0.6452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2697  aldo/keto reductase  69.49 
 
 		 354 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2755  aldo/keto reductase  69.21 
 
 		 353 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2245  aldo/keto reductase  69.21 
 
 		 353 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1849  aldo/keto reductase  69.12 
 
 		 353 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4794  aldo/keto reductase  68.36 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3476  aldo/keto reductase  68.47 
 
 		 353 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.293205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3774  aldo/keto reductase  66.57 
 
 		 353 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1212  aldo/keto reductase  58.15 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  54.42 
 
 		 346 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1316  aldo/keto reductase  57.1 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1120  aldo/keto reductase  53.47 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00427173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1648  aldo/keto reductase  53.43 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1257  aldo/keto reductase  52.69 
 
 		 345 aa  348  8e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5010  aldo/keto reductase  46.72 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.714816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1541  aldo/keto reductase  49.28 
 
 		 346 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.941337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.57 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4410  aldo/keto reductase  49.29 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.332653  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4535  aldo/keto reductase  49.58 
 
 		 346 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  49.71 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0900  aldo/keto reductase  50 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.933192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  49.72 
 
 		 343 aa  315  8e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4695  aldo/keto reductase  47.58 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182273  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.03 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0921  aldo/keto reductase  48.16 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2296  aldo/keto reductase  48.72 
 
 		 345 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209933  decreased coverage  0.0000407872 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.61 
 
 		 350 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3243  aldo/keto reductase  48.29 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1222  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.33 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1849  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.33 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0364  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.33 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1836  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.33 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  47.18 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0797  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.33 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1707  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.33 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57600  putative oxidoreductase  47.29 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.855997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3022  putative aldo-keto reductase  48.86 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0156973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5006  putative oxidoreductase  46.86 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1565  aldo/keto reductase  46.48 
 
 		 350 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2669  aldo/keto reductase  45.14 
 
 		 345 aa  305  8.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.634348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2491  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.29 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1484  aldo/keto reductase  46.76 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488323  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1649  aldo/keto reductase  46.48 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3180  aldo/keto reductase  47.16 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1504  aldo/keto reductase  46.48 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2478  oxidoreductase  46.61 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4726  aldo/keto reductase  46.2 
 
 		 350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3496  aldo/keto reductase  46.86 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  47.58 
 
 		 346 aa  302  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1638  aldo/keto reductase  46.07 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336172 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0754  aldo/keto reductase  47.43 
 
 		 346 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1108  aldo/keto reductase  46.2 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1588  aldo/keto reductase  46.2 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3686  aldo/keto reductase  46.86 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0158243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22370  Aldo/keto reductase  47.83 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2284  aldo/keto reductase  49.43 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  47.29 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0753  aldo/keto reductase  46.57 
 
 		 346 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0608854  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2569  aldo/keto reductase  47.44 
 
 		 344 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133654  normal  0.0183091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  48.43 
 
 		 344 aa  298  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3126  aldo/keto reductase  44.19 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  47.67 
 
 		 346 aa  297  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0848  aldo/keto reductase  46 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.509349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3565  aldo/keto reductase  46.57 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.556648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0199  aldo/keto reductase family oxidoreductase TAS  48.15 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3379  aldo/keto reductase  45.71 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0979  putative aldo-keto reductase  46.15 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000256881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1031  putative aldo-keto reductase  46.15 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0194633  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3243  putative aldo-keto reductase  46.15 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000690689  normal  0.0202789 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0900  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.43 
 
 		 346 aa  295  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3273  aldo/keto reductase  45.71 
 
 		 346 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0747  aldo/keto reductase  45.43 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  46.8 
 
 		 353 aa  292  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3664  aldo/keto reductase  48.17 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.160957 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01770  Aldo/keto reductase  46.29 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2624  putative oxidoreductase  45.33 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.7862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0736  aldo/keto reductase  45.43 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1125  aldo/keto reductase  49.72 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  47.74 
 
 		 346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  47.86 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0860  aldo/keto reductase  45.33 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0830  aldo/keto reductase  42.05 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0855  aldo/keto reductase  45.33 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0768  aldo/keto reductase  45.74 
 
 		 347 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1391  aldo/keto reductase  46.05 
 
 		 346 aa  281  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2776  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.86 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02682  predicted oxidoreductase, NADP(H)-dependent aldo-keto reductase  46.31 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0856  aldo/keto reductase  46.31 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00288116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4101  putative aldo-keto reductase  46.31 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000408733  hitchhiker  0.00103859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2981  putative aldo-keto reductase  46.31 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02643  hypothetical protein  46.31 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2982  putative aldo-keto reductase  46.31 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0288207  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3275  putative aldo-keto reductase  45.43 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  46.02 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  46.02 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0511  aldo/keto reductase  46.22 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0743  aldo/keto reductase  48.45 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357174  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3236  putative aldo-keto reductase  45.74 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0896684  hitchhiker  0.000000643826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>