More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0743 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0743  aldo/keto reductase  100 
 
 		 347 aa  715    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357174  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1526  aldo/keto reductase  68.59 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1055  aldo/keto reductase  64.27 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1198  aldo/keto reductase  63.66 
 
 		 347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3708  aldo/keto reductase  56.56 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0423  aldo/keto reductase  54.62 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2079  aldo/keto reductase  54.62 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.042571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2347  aldo/keto reductase  55.06 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2190  aldo/keto reductase  53.74 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.888803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2823  aldo/keto reductase  50.86 
 
 		 348 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3142  aldo/keto reductase  48.41 
 
 		 374 aa  347  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  50.57 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4695  aldo/keto reductase  51.86 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182273  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  51.15 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0900  aldo/keto reductase  51.29 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.933192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0199  aldo/keto reductase family oxidoreductase TAS  49.57 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  52.15 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2284  aldo/keto reductase  51.44 
 
 		 346 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2350  aldo/keto reductase  50.7 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.788552  normal  0.04673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2296  aldo/keto reductase  51 
 
 		 345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209933  decreased coverage  0.0000407872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57600  putative oxidoreductase  49.57 
 
 		 345 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.855997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  50.29 
 
 		 345 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3664  aldo/keto reductase  49.86 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.160957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1391  aldo/keto reductase  48.32 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1541  aldo/keto reductase  49.57 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.941337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2491  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.57 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5006  putative oxidoreductase  49.28 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  48.56 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0511  aldo/keto reductase  48.31 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0736  aldo/keto reductase  48.86 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4535  aldo/keto reductase  49.43 
 
 		 346 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1316  aldo/keto reductase  50.71 
 
 		 352 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1257  aldo/keto reductase  51.43 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4410  aldo/keto reductase  49.14 
 
 		 346 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.332653  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1212  aldo/keto reductase  49.86 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.86 
 
 		 346 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0830  aldo/keto reductase  45.71 
 
 		 345 aa  323  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  48.31 
 
 		 350 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3022  putative aldo-keto reductase  47.73 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0156973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  46.59 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5010  aldo/keto reductase  49.14 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.714816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1484  aldo/keto reductase  47.74 
 
 		 350 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2569  aldo/keto reductase  49.71 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133654  normal  0.0183091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2478  oxidoreductase  48.03 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1504  aldo/keto reductase  47.46 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.44 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1649  aldo/keto reductase  47.74 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4726  aldo/keto reductase  47.74 
 
 		 350 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3262  aldo/keto reductase  47.86 
 
 		 350 aa  319  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.88 
 
 		 350 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1222  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.6 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1707  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.6 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0364  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.6 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1836  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.6 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1849  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.6 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0797  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.6 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00708  putative NADPH-dependent aldose reductase  46.84 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.791046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  47.44 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3243  aldo/keto reductase  48.86 
 
 		 344 aa  315  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1565  aldo/keto reductase  47.18 
 
 		 350 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0921  aldo/keto reductase  47.71 
 
 		 346 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0754  aldo/keto reductase  47.71 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1638  aldo/keto reductase  47.18 
 
 		 350 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3273  aldo/keto reductase  47.71 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3379  aldo/keto reductase  47.71 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1031  putative aldo-keto reductase  45.81 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0194633  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0979  putative aldo-keto reductase  45.81 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000256881  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3243  putative aldo-keto reductase  45.81 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000690689  normal  0.0202789 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0900  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.43 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0747  aldo/keto reductase  47.43 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1865  aldo/keto reductase  46.26 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000172357  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1108  aldo/keto reductase  46.89 
 
 		 350 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1588  aldo/keto reductase  46.89 
 
 		 350 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2776  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.13 
 
 		 345 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3180  aldo/keto reductase  47.43 
 
 		 346 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22370  Aldo/keto reductase  48.14 
 
 		 346 aa  311  9e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0855  aldo/keto reductase  47.43 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2824  aldo/keto reductase  53 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3686  aldo/keto reductase  46.86 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0158243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  45.45 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4994  aldo/keto reductase  47.77 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0848  aldo/keto reductase  46.86 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.509349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3496  aldo/keto reductase  46.57 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2624  putative oxidoreductase  46.15 
 
 		 347 aa  309  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.7862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3994  aldo/keto reductase  47.29 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.461301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0768  aldo/keto reductase  46.86 
 
 		 347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0753  aldo/keto reductase  46.57 
 
 		 346 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0608854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1125  aldo/keto reductase  50.42 
 
 		 351 aa  308  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3565  aldo/keto reductase  46.57 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.556648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2982  putative aldo-keto reductase  46.63 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0288207  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2981  putative aldo-keto reductase  46.63 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02682  predicted oxidoreductase, NADP(H)-dependent aldo-keto reductase  46.63 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0856  aldo/keto reductase  46.63 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00288116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0860  aldo/keto reductase  47.14 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02643  hypothetical protein  46.63 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  46.35 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  46.35 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1120  aldo/keto reductase  47.16 
 
 		 348 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00427173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4101  putative aldo-keto reductase  46.35 
 
 		 346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000408733  hitchhiker  0.00103859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  45.63 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>