More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00708 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00708  putative NADPH-dependent aldose reductase  100 
 
 
350 aa  730    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.791046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3262  aldo/keto reductase  62.29 
 
 
350 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3994  aldo/keto reductase  60 
 
 
350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.461301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2350  aldo/keto reductase  59.14 
 
 
350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.788552  normal  0.04673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1526  aldo/keto reductase  49.15 
 
 
347 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0743  aldo/keto reductase  46.84 
 
 
347 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357174  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1055  aldo/keto reductase  46.99 
 
 
347 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1198  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
347 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0199  aldo/keto reductase family oxidoreductase TAS  45.66 
 
 
352 aa  294  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  45.58 
 
 
350 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  44.86 
 
 
344 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1638  aldo/keto reductase  45.3 
 
 
350 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.336172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57600  putative oxidoreductase  44.86 
 
 
345 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.855997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2491  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.76 
 
 
345 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4695  aldo/keto reductase  45.14 
 
 
346 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182273  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  43.97 
 
 
345 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2478  oxidoreductase  45.01 
 
 
366 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2296  aldo/keto reductase  45.61 
 
 
345 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209933  decreased coverage  0.0000407872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  45.51 
 
 
346 aa  289  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3708  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
345 aa  288  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2569  aldo/keto reductase  44.32 
 
 
344 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133654  normal  0.0183091 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1222  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.35 
 
 
350 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5010  aldo/keto reductase  44.86 
 
 
345 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.714816 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1707  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.35 
 
 
350 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0364  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.35 
 
 
350 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0797  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.35 
 
 
350 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  44.57 
 
 
344 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1649  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
350 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456343  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1836  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.35 
 
 
350 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1849  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.35 
 
 
350 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 
350 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.35 
 
 
350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2284  aldo/keto reductase  44.83 
 
 
346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3142  aldo/keto reductase  43.79 
 
 
374 aa  282  6.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5006  putative oxidoreductase  43.14 
 
 
345 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4535  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
346 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3243  aldo/keto reductase  44.29 
 
 
344 aa  278  7e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.23 
 
 
346 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428097  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0754  aldo/keto reductase  42.17 
 
 
346 aa  278  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4410  aldo/keto reductase  44.23 
 
 
346 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.332653  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0900  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
345 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.933192  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49070  predicted protein  43.96 
 
 
381 aa  277  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01770  Aldo/keto reductase  43.06 
 
 
345 aa  276  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2624  putative oxidoreductase  41.53 
 
 
347 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.7862  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0921  aldo/keto reductase  44.94 
 
 
346 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2823  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
348 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.299574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  44.73 
 
 
346 aa  275  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3180  aldo/keto reductase  41.81 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1541  aldo/keto reductase  45.01 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.941337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2190  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.888803  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1108  aldo/keto reductase  42.42 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1565  aldo/keto reductase  42.42 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1588  aldo/keto reductase  42.42 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1484  aldo/keto reductase  43.02 
 
 
350 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1504  aldo/keto reductase  43.68 
 
 
350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  43.14 
 
 
346 aa  272  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4726  aldo/keto reductase  42.82 
 
 
350 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0736  aldo/keto reductase  42.69 
 
 
346 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2079  aldo/keto reductase  43.59 
 
 
346 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.042571  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0979  putative aldo-keto reductase  42.69 
 
 
346 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000256881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1031  putative aldo-keto reductase  42.69 
 
 
346 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0194633  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3243  putative aldo-keto reductase  42.69 
 
 
346 aa  269  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000690689  normal  0.0202789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3379  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0900  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.93 
 
 
346 aa  268  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1648  aldo/keto reductase  43.64 
 
 
350 aa  269  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0860  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
347 aa  268  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  42.98 
 
 
346 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2669  aldo/keto reductase  42.29 
 
 
345 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.634348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0747  aldo/keto reductase  42.65 
 
 
346 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1212  aldo/keto reductase  42.61 
 
 
352 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3273  aldo/keto reductase  42.36 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1316  aldo/keto reductase  41.81 
 
 
352 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
343 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22370  Aldo/keto reductase  42.94 
 
 
346 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0855  aldo/keto reductase  40.97 
 
 
347 aa  266  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0398  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
346 aa  266  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.537596  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0423  aldo/keto reductase  42.74 
 
 
346 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4994  aldo/keto reductase  43.14 
 
 
350 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570117  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  42.33 
 
 
353 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  42.33 
 
 
346 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3686  aldo/keto reductase  42.01 
 
 
346 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0158243 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3496  aldo/keto reductase  42.01 
 
 
346 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.496722  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0511  aldo/keto reductase  42.7 
 
 
356 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0753  aldo/keto reductase  42.01 
 
 
346 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0608854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0768  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
347 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0357  putative oxidoreductase, aldo/keto reductase  41.88 
 
 
346 aa  260  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0848  aldo/keto reductase  40.86 
 
 
346 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.509349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3565  aldo/keto reductase  42.01 
 
 
346 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.556648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2347  aldo/keto reductase  43.23 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022862  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2776  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.71 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3275  putative aldo-keto reductase  42.05 
 
 
346 aa  259  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1865  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
346 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000172357  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0830  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
345 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3664  aldo/keto reductase  41.48 
 
 
349 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.160957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1391  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
346 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4101  putative aldo-keto reductase  41.76 
 
 
346 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000408733  hitchhiker  0.00103859 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12673  predicted protein  45.27 
 
 
355 aa  256  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0856  aldo/keto reductase  41.76 
 
 
346 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00288116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  41.48 
 
 
346 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  41.48 
 
 
346 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>