More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3994 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3994  aldo/keto reductase  100 
 
 		 350 aa  731    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.461301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2350  aldo/keto reductase  65.71 
 
 		 350 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.788552  normal  0.04673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3262  aldo/keto reductase  66 
 
 		 350 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00708  putative NADPH-dependent aldose reductase  60 
 
 		 350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.791046  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1526  aldo/keto reductase  49 
 
 		 347 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3708  aldo/keto reductase  49.13 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1055  aldo/keto reductase  47.58 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0743  aldo/keto reductase  47.29 
 
 		 347 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357174  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3243  aldo/keto reductase  45.01 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  45.51 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0199  aldo/keto reductase family oxidoreductase TAS  45.14 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2624  putative oxidoreductase  44.63 
 
 		 347 aa  301  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.7862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1198  aldo/keto reductase  46.55 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3180  aldo/keto reductase  42.78 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  43.84 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  44 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5010  aldo/keto reductase  44.32 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.714816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0768  aldo/keto reductase  43.06 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2296  aldo/keto reductase  44.73 
 
 		 345 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209933  decreased coverage  0.0000407872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0855  aldo/keto reductase  41.88 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2491  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.16 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  44.26 
 
 		 346 aa  288  9e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0848  aldo/keto reductase  43.3 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.509349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0900  aldo/keto reductase  45.17 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.933192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0754  aldo/keto reductase  42.21 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3273  aldo/keto reductase  43.22 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3379  aldo/keto reductase  42.74 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2284  aldo/keto reductase  43.71 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  44.92 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3496  aldo/keto reductase  42.74 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4994  aldo/keto reductase  45.4 
 
 		 350 aa  286  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0900  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.45 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3686  aldo/keto reductase  42.74 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0158243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3565  aldo/keto reductase  42.74 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.556648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0747  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0753  aldo/keto reductase  42.74 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0608854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0736  aldo/keto reductase  42.74 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.38 
 
 		 350 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0860  aldo/keto reductase  41.6 
 
 		 347 aa  285  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1222  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.1 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  44.54 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  43.43 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1707  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.1 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0364  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.1 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0797  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.1 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1316  aldo/keto reductase  42.12 
 
 		 352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1541  aldo/keto reductase  45.17 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.941337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4695  aldo/keto reductase  44.89 
 
 		 346 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182273  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57600  putative oxidoreductase  44.32 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.855997 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1836  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.1 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1849  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.1 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.1 
 
 		 350 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1638  aldo/keto reductase  44.26 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336172 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  42.57 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5006  putative oxidoreductase  43.47 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1649  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2669  aldo/keto reductase  42.7 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.634348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1212  aldo/keto reductase  43.52 
 
 		 352 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2079  aldo/keto reductase  43.82 
 
 		 346 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.042571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4535  aldo/keto reductase  45.17 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0423  aldo/keto reductase  43.26 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0921  aldo/keto reductase  44.6 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4726  aldo/keto reductase  43.7 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2569  aldo/keto reductase  42 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133654  normal  0.0183091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1504  aldo/keto reductase  43.98 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2478  oxidoreductase  43.7 
 
 		 366 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4410  aldo/keto reductase  45.17 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.332653  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1484  aldo/keto reductase  43.7 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488323  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1565  aldo/keto reductase  42.82 
 
 		 350 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1108  aldo/keto reductase  42.82 
 
 		 350 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1588  aldo/keto reductase  42.82 
 
 		 350 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.89 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49070  predicted protein  44.01 
 
 		 381 aa  272  5.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2347  aldo/keto reductase  44.93 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1648  aldo/keto reductase  43.22 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3275  putative aldo-keto reductase  41.24 
 
 		 346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2823  aldo/keto reductase  41.93 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  41.81 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01770  Aldo/keto reductase  42.17 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0979  putative aldo-keto reductase  42.37 
 
 		 346 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000256881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1031  putative aldo-keto reductase  42.37 
 
 		 346 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0194633  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3243  putative aldo-keto reductase  42.37 
 
 		 346 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000690689  normal  0.0202789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22370  Aldo/keto reductase  42.61 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1120  aldo/keto reductase  41.76 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00427173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2776  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.88 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4101  putative aldo-keto reductase  41.24 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000408733  hitchhiker  0.00103859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02682  predicted oxidoreductase, NADP(H)-dependent aldo-keto reductase  41.24 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0856  aldo/keto reductase  41.24 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00288116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  42.09 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3022  putative aldo-keto reductase  41.24 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0156973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0830  aldo/keto reductase  41.31 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02643  hypothetical protein  41.24 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  40.96 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  41.39 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2982  putative aldo-keto reductase  40.96 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0288207  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  40.96 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2981  putative aldo-keto reductase  40.96 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1257  aldo/keto reductase  40.73 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1391  aldo/keto reductase  41.36 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3028  putative aldo-keto reductase  40.96 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000422385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>