More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3494 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  100 
 
 		 316 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  66.45 
 
 		 315 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  65.5 
 
 		 315 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  61.34 
 
 		 317 aa  404  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  60.63 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  58.1 
 
 		 313 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  58.73 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  58.41 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  59.8 
 
 		 317 aa  361  8e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  57.1 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.91 
 
 		 315 aa  358  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  58.41 
 
 		 313 aa  358  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.23 
 
 		 315 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.23 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.23 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.23 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.23 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  57.51 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.91 
 
 		 331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.23 
 
 		 463 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  57.51 
 
 		 321 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  55.7 
 
 		 316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 317 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  56.87 
 
 		 314 aa  349  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  55.56 
 
 		 322 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  57.89 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  55.38 
 
 		 317 aa  345  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  56.65 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  58.73 
 
 		 316 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  56.33 
 
 		 315 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  58.1 
 
 		 320 aa  341  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  53.33 
 
 		 316 aa  341  9e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  54.6 
 
 		 315 aa  341  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  57.64 
 
 		 318 aa  341  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  55.73 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  58.41 
 
 		 316 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  54.29 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  56.01 
 
 		 315 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  54.43 
 
 		 315 aa  335  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  57.88 
 
 		 323 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  52.22 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  52.85 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  55.38 
 
 		 315 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  53.5 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  55.06 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  55.06 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  55.24 
 
 		 320 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  56.25 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  53.65 
 
 		 316 aa  315  9e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  50.66 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  45.73 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  48.09 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  49.36 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  49.04 
 
 		 321 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  44.82 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  48.87 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  50.65 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  46.81 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  47.24 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  43.61 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.44 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  43.22 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  42.44 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  39.4 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  40.85 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  38.12 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  37.3 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  37.07 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  36 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  38.85 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  36.53 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  39.31 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.72 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  36.2 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  36 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  37.31 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  38.27 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  35.08 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  35.38 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  37.73 
 
 		 343 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1363  aldo/keto reductase  33.53 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  38.04 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  35.69 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  38.44 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  36.89 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  37.05 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  37.42 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  36.62 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  37.62 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  37.11 
 
 		 325 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  37.09 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  37.35 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  36.25 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  36.25 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>