More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2700 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  100 
 
 
321 aa  657    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  76.88 
 
 
320 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  71.96 
 
 
321 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  71.96 
 
 
321 aa  481  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  67.83 
 
 
317 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  62.74 
 
 
322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  62.74 
 
 
318 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  59.56 
 
 
326 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  61.46 
 
 
317 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  60.97 
 
 
323 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  58.15 
 
 
316 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  60.38 
 
 
313 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  61.02 
 
 
313 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  59.42 
 
 
320 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  61.46 
 
 
316 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  60.83 
 
 
316 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  57.37 
 
 
325 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  59.87 
 
 
315 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
313 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  56.69 
 
 
317 aa  363  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.32 
 
 
334 aa  361  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.32 
 
 
334 aa  361  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.32 
 
 
334 aa  361  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.32 
 
 
334 aa  361  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.32 
 
 
315 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.32 
 
 
463 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60 
 
 
331 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  57.23 
 
 
324 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  57.61 
 
 
314 aa  357  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  57.96 
 
 
320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  59.05 
 
 
315 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  55.91 
 
 
314 aa  349  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  58.41 
 
 
315 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  58.1 
 
 
315 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  55.59 
 
 
311 aa  346  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  57.78 
 
 
315 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  57.64 
 
 
315 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  57.64 
 
 
315 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  57.64 
 
 
315 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  54.49 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  52.87 
 
 
316 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  53.5 
 
 
316 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  51.76 
 
 
315 aa  316  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  54.05 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  50.32 
 
 
317 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  49.36 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  51.77 
 
 
312 aa  301  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  50 
 
 
321 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  50.33 
 
 
318 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  50.65 
 
 
321 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  50 
 
 
321 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  47.09 
 
 
342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  46.18 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  55.89 
 
 
307 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  52.61 
 
 
314 aa  275  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  45.11 
 
 
329 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  44.1 
 
 
325 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  47.23 
 
 
318 aa  252  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  44.98 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  45.51 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.16 
 
 
341 aa  222  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
331 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
353 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
309 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.5 
 
 
313 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
333 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
313 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.89 
 
 
331 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  39.31 
 
 
313 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
317 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  38.63 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.56 
 
 
331 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  38.36 
 
 
313 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
349 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
350 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
333 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  39.22 
 
 
349 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  39.76 
 
 
349 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  39.14 
 
 
345 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  36.98 
 
 
345 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  38.53 
 
 
349 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  36.36 
 
 
351 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  38.75 
 
 
332 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  39.09 
 
 
349 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  40.18 
 
 
339 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  35.98 
 
 
348 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
339 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  37.93 
 
 
325 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  36.06 
 
 
351 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  36.06 
 
 
351 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  40.73 
 
 
352 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
352 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  36.88 
 
 
340 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  38.96 
 
 
350 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>