More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0108 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  100 
 
 		 345 aa  701    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  77.81 
 
 		 338 aa  548  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  77.45 
 
 		 338 aa  541  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  77.45 
 
 		 338 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  77.22 
 
 		 339 aa  534  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  77.22 
 
 		 339 aa  534  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  65.8 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  66.08 
 
 		 360 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  68.05 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  68.05 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  67.05 
 
 		 349 aa  474  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  67.75 
 
 		 349 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  64.9 
 
 		 346 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  67.75 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  69.05 
 
 		 340 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  65.49 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  58.53 
 
 		 349 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  59.28 
 
 		 353 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  58.82 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  58.53 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  58.53 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  58.82 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  58.24 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  58.24 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  55.69 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  55.62 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  52.33 
 
 		 378 aa  345  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  45.4 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  47.81 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  46.02 
 
 		 355 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 349 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  46.08 
 
 		 350 aa  288  8e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  46.83 
 
 		 352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  45.32 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  46.53 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  44.22 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  41.04 
 
 		 359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  46.73 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 357 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  44.88 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  45.71 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  46.37 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  41 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  42.65 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  42.18 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 326 aa  258  8e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  43.44 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  42.6 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  42.65 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  41.76 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  42.06 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  45.17 
 
 		 325 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  44.27 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  43.24 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  43.83 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 349 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  44.51 
 
 		 343 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  43.61 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  40.99 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 345 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  40.92 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  44.21 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  41.09 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 347 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 316 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  42.42 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  41.3 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  41.07 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  43.62 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  41 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  41 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  43.08 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  42.37 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  40.92 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  42.35 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  42.35 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  42.35 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.28 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  42.09 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  42.65 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  40.95 
 
 		 349 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  43.85 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  42.6 
 
 		 337 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  42.95 
 
 		 326 aa  239  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 332 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  38.96 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  40.69 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.21 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  42.14 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  43.7 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>