More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4309 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  97.38 
 
 
389 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  100 
 
 
344 aa  702    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  97.38 
 
 
344 aa  688    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  84.01 
 
 
343 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  76.74 
 
 
343 aa  547  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  70.29 
 
 
344 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  69.48 
 
 
342 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  67.73 
 
 
342 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  66.57 
 
 
341 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  65.98 
 
 
341 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  66.08 
 
 
349 aa  441  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  63.16 
 
 
345 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  62.5 
 
 
347 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  63.53 
 
 
340 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  62.68 
 
 
344 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  61.52 
 
 
349 aa  424  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  61.22 
 
 
344 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  62.97 
 
 
345 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  63.56 
 
 
345 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  63.27 
 
 
345 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  60.93 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  62.39 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  62.39 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  62.39 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  65.22 
 
 
343 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  60.35 
 
 
345 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  65.42 
 
 
343 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  62.68 
 
 
344 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  61.81 
 
 
344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  61.22 
 
 
344 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  58.48 
 
 
342 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  58.19 
 
 
342 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  58.19 
 
 
342 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  54.68 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  55.72 
 
 
354 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  55.56 
 
 
352 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  54.08 
 
 
349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  51.95 
 
 
355 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  51.95 
 
 
350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  48.66 
 
 
359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  46.55 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  47.45 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  51.35 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  48.04 
 
 
351 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  45.48 
 
 
349 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  45.21 
 
 
357 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  45.78 
 
 
349 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  45.78 
 
 
349 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
350 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  44.35 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  44.28 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  46.25 
 
 
339 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  46.39 
 
 
338 aa  279  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
339 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  44.91 
 
 
346 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  45.78 
 
 
338 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  45.78 
 
 
338 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  44.25 
 
 
351 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  44.25 
 
 
351 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  45.37 
 
 
378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  43.97 
 
 
370 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  44.25 
 
 
351 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  43.07 
 
 
345 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  41.92 
 
 
338 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  39.23 
 
 
358 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  40.96 
 
 
342 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
351 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  44.91 
 
 
335 aa  261  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  44.19 
 
 
343 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  45.51 
 
 
340 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
349 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
341 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
349 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
339 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.67 
 
 
325 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.12 
 
 
343 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  39.35 
 
 
361 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  40.23 
 
 
343 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  40.23 
 
 
343 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
360 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
343 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  43.3 
 
 
333 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  41.19 
 
 
343 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
327 aa  235  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  40.95 
 
 
358 aa  232  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  39.4 
 
 
334 aa  232  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.15 
 
 
343 aa  231  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  40.42 
 
 
361 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
368 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
323 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.59 
 
 
344 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  40 
 
 
368 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
313 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  39.14 
 
 
313 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
322 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>