More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2813 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  100 
 
 		 349 aa  712    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  81.4 
 
 		 349 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  81.74 
 
 		 350 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  78.84 
 
 		 349 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  78.84 
 
 		 349 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  77.75 
 
 		 348 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  77.1 
 
 		 346 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  67.05 
 
 		 345 aa  474  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  68.93 
 
 		 338 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  68.24 
 
 		 339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  68.34 
 
 		 338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  68.24 
 
 		 339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  67.35 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  68.96 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  62.65 
 
 		 349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  63.61 
 
 		 353 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  62.06 
 
 		 349 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  64.91 
 
 		 361 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  64.43 
 
 		 360 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  62.65 
 
 		 370 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  62.14 
 
 		 351 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  61.76 
 
 		 351 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  62.06 
 
 		 351 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  62.06 
 
 		 351 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  57.14 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  60.36 
 
 		 342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  55.81 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  51.04 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  52.73 
 
 		 352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  51.06 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  46.22 
 
 		 350 aa  298  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  47.13 
 
 		 354 aa  296  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  46.06 
 
 		 339 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  47.89 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  46.55 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  46.84 
 
 		 352 aa  288  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  43.45 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  45.59 
 
 		 351 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  43.98 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  43.98 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  44.28 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 344 aa  282  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  44.58 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  41.99 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  42.56 
 
 		 349 aa  272  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 343 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  46.39 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 345 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  41.42 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  45.6 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  44.64 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  44.35 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  44.35 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  44.35 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  40.79 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  41.09 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  42.01 
 
 		 344 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  42.09 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  44.94 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  42.31 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  45.79 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  45.15 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  42.01 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  44.62 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  42.01 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  43.04 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 326 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  44.86 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  42.01 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  40.48 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  42.59 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  43.95 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  40 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  41.88 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  42.99 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  42.01 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  44.48 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  42.39 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.99 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  41.19 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  42.14 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  43.83 
 
 		 326 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 326 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  43.65 
 
 		 326 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  41.32 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  41.79 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  39.82 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 343 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>