More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2911 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  100 
 
 		 343 aa  690    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  88.05 
 
 		 343 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  72.67 
 
 		 344 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  69.21 
 
 		 349 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  73.31 
 
 		 345 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  73.02 
 
 		 345 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  69.21 
 
 		 345 aa  491  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  72.73 
 
 		 345 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  68.31 
 
 		 344 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  72.43 
 
 		 345 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  68.6 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  72.73 
 
 		 345 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  72.73 
 
 		 345 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  71.14 
 
 		 341 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  70.26 
 
 		 341 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  71.51 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  70.93 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  70.93 
 
 		 344 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  67.35 
 
 		 342 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  70.93 
 
 		 344 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  65.2 
 
 		 344 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  62.24 
 
 		 340 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  62.65 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  63.47 
 
 		 342 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  63.53 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  63.17 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  63.17 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  63.85 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  62.57 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  62.57 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  59.16 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  59.1 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  57.53 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  59.02 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  54.71 
 
 		 349 aa  339  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  51.98 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  51.21 
 
 		 352 aa  315  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  48.78 
 
 		 354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  48.64 
 
 		 350 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  47.11 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  46.18 
 
 		 359 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  45.37 
 
 		 352 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  45.37 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  43.98 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  45.43 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  45.21 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  49.24 
 
 		 349 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  45.35 
 
 		 378 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  43.48 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  43.48 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  45.9 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  44.68 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  44.07 
 
 		 349 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  45.9 
 
 		 350 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  44.78 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  42.65 
 
 		 348 aa  258  9e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  42.12 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  45.67 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  42.65 
 
 		 349 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  38.97 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  43.47 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  40.18 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  43.16 
 
 		 338 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  42.59 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  43.88 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  42.73 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  42.6 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  42.6 
 
 		 351 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  42.6 
 
 		 351 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  42.35 
 
 		 333 aa  242  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 351 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  43.1 
 
 		 344 aa  241  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  41.09 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  41.99 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.68 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  40.61 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  42.24 
 
 		 343 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  42.14 
 
 		 313 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  41.19 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.91 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  41.89 
 
 		 332 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.31 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  40.19 
 
 		 322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.19 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  40.61 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  41.87 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  39.52 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  41.61 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  41.12 
 
 		 334 aa  232  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  39.69 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  42.01 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  40.99 
 
 		 333 aa  229  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.48 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>