More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5958 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  89.46 
 
 		 351 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  89.46 
 
 		 351 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  98.58 
 
 		 351 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  89.46 
 
 		 351 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  100 
 
 		 370 aa  749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  66.09 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  65.22 
 
 		 349 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  63.56 
 
 		 349 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  64.88 
 
 		 353 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  63.93 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  63.93 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  62.65 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  62.39 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  61.34 
 
 		 346 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  59.88 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  58.53 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  58.53 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  58.24 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  58.24 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  62.8 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  57.48 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  57.18 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  53.33 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  54.36 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  55.36 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  53.6 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  50.45 
 
 		 338 aa  335  9e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  52.11 
 
 		 352 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  50.75 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  48.65 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  48.65 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  46.99 
 
 		 339 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  47.15 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  47.31 
 
 		 352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  47.15 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  44.28 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  43.52 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  44.25 
 
 		 344 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 345 aa  268  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  44.25 
 
 		 389 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.78 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  43.97 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  44.51 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  44.22 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  46.08 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  42.49 
 
 		 343 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  42.49 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  43.64 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  42.44 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  47.29 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  44.01 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 349 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  42.11 
 
 		 351 aa  259  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  43.55 
 
 		 345 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  43.55 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  43.55 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  43.55 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  42.77 
 
 		 331 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  43.06 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  42.98 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  42.2 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  44.54 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  43.92 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  42.49 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.24 
 
 		 343 aa  249  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  42.32 
 
 		 325 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  39.94 
 
 		 340 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.22 
 
 		 332 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  40.98 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 343 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  43.87 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  41.27 
 
 		 336 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  39.76 
 
 		 347 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.57 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.65 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  39.31 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  43.44 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  44.08 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  42.33 
 
 		 343 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  41.88 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  44.48 
 
 		 343 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 333 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  41.14 
 
 		 326 aa  236  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  41.09 
 
 		 342 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 322 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  40 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  41.83 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  43.34 
 
 		 349 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  43.12 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>