More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0283 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  100 
 
 
315 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  76.43 
 
 
315 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  68.57 
 
 
317 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  59.68 
 
 
322 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  57.78 
 
 
333 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  57.86 
 
 
316 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  56.37 
 
 
332 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  55.41 
 
 
332 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  53.18 
 
 
321 aa  368  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  54.46 
 
 
324 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  54.29 
 
 
333 aa  362  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  52.85 
 
 
334 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  52.53 
 
 
328 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  51.11 
 
 
334 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  52.53 
 
 
331 aa  347  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  53 
 
 
337 aa  341  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  51.58 
 
 
336 aa  337  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
332 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
327 aa  335  7e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  50.96 
 
 
316 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  49.37 
 
 
336 aa  329  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
337 aa  329  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  48.76 
 
 
342 aa  328  8e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  48.1 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  50 
 
 
336 aa  325  7e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
316 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  49.52 
 
 
334 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  47.3 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  48.73 
 
 
336 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  48.9 
 
 
338 aa  318  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  49.52 
 
 
334 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  47.02 
 
 
329 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  49.05 
 
 
335 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  46.84 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  46.03 
 
 
335 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  46.39 
 
 
329 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0838  aldo/keto reductase  48.75 
 
 
322 aa  310  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  48.73 
 
 
334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  46.5 
 
 
310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  46.67 
 
 
325 aa  305  7e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  48.12 
 
 
319 aa  301  9e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  47.81 
 
 
319 aa  299  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0148  aldo/keto reductase  48.91 
 
 
319 aa  298  6e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00957933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  44.48 
 
 
314 aa  298  8e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2158  aldo/keto reductase  47.95 
 
 
321 aa  292  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
315 aa  292  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0809  aldo/keto reductase  45.62 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0086  voltage-dependent potassium channel, beta subunit  44.27 
 
 
332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1392  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203744  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3157  putative voltage-gated potassium channel, beta subunit  44.38 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1962  aldo/keto reductase  45 
 
 
323 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.575618  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  43.03 
 
 
327 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
327 aa  275  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2251  aldo/keto reductase  43.85 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2130  aldo/keto reductase  43.85 
 
 
323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940949  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2237  aldo/keto reductase  43.44 
 
 
323 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5541  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
323 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2039  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.5 
 
 
323 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2213  aldo/keto reductase  43.44 
 
 
323 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0875  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.5 
 
 
323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.73472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1917  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.5 
 
 
323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.5 
 
 
323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0919  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.5 
 
 
323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1064  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680696  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0600  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.5 
 
 
323 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0504  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.5 
 
 
323 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5864  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
323 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
329 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0643  aldo/keto reductase  43.28 
 
 
323 aa  265  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.671834  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
329 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0255  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.72 
 
 
330 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04673  voltage-gated potassium channel beta subunit  42.62 
 
 
322 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0553  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0539  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1791  aldo/keto reductase  43.09 
 
 
321 aa  249  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  40.56 
 
 
325 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3413  aldo/keto reductase  45 
 
 
329 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1862  voltage-gated potassium channel beta subunit  42.43 
 
 
321 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
337 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21730  Oxidoreductase aldo/keto reductase family  42.45 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
351 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
351 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  38.65 
 
 
370 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4823  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
345 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0252  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
345 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0351  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.5 
 
 
345 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
351 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
325 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5157  hypothetical protein  42.27 
 
 
347 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
337 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  38.67 
 
 
351 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  39.24 
 
 
343 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2232  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
338 aa  238  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.342948  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
351 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3688  aldo/keto reductase  43.56 
 
 
348 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  37.85 
 
 
346 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3408  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
345 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>