More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3996 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  100 
 
 		 336 aa  678    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  70.54 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  67.47 
 
 		 331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  66.87 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  66.27 
 
 		 331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  47.52 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  45.2 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  41.74 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  43.6 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  41.14 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  42.64 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.8 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  41.27 
 
 		 370 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  42.95 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  43.17 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  42.09 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  40.36 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  40.36 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  42.01 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  40 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  40.36 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  42.99 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  43.45 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  41.49 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.18 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  41.72 
 
 		 349 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  40.36 
 
 		 351 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  43.89 
 
 		 333 aa  235  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  43.59 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  43.08 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  41.49 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  41.18 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  42.69 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  42.69 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  41.07 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  40.41 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  41.88 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  40.91 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.12 
 
 		 315 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 332 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.19 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  42.63 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  40.71 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.63 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  37.42 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  41.38 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.07 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  41.21 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.72 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  39.44 
 
 		 315 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  40.48 
 
 		 358 aa  229  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  42.02 
 
 		 326 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  41.46 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  40.72 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  42.24 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  42.25 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  42.72 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  40 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  40.76 
 
 		 326 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  41.52 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  39.69 
 
 		 313 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.94 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.44 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 326 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  37.88 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  39.7 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  39.26 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  40.51 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1363  aldo/keto reductase  38.87 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  37.72 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  40.99 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.69 
 
 		 344 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  42.95 
 
 		 344 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  42.32 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0264  aldo/keto reductase  43.08 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  39.45 
 
 		 352 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  39.06 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  40.54 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  42.56 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  41.59 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  40.73 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  42.9 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  39.56 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  38.82 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  39.54 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  41.64 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  43.58 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  43.34 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  41.01 
 
 		 326 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  40.84 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  39.62 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>