More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4686 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  100 
 
 		 342 aa  710    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  64.14 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  60.78 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  60.78 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  60.06 
 
 		 349 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  60.06 
 
 		 349 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  60.36 
 
 		 349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  60.12 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  58.88 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  58.11 
 
 		 346 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  56.64 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  56.93 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  59.47 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  55.92 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  56.8 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  55.92 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  55.62 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 370 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  53.35 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  53.67 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  51.75 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  52.16 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  51.17 
 
 		 349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  53.51 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  49.85 
 
 		 338 aa  351  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  50 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  50.44 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  47.65 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  46.53 
 
 		 357 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  43.66 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  44.71 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 354 aa  285  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  43.88 
 
 		 347 aa  282  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  43.64 
 
 		 352 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  43.64 
 
 		 352 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  44.35 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  44.69 
 
 		 326 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  43.44 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  42.4 
 
 		 343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  41.81 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  43.15 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  45.16 
 
 		 352 aa  272  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  44.79 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 325 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  41.89 
 
 		 359 aa  271  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  43.56 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  43.26 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  42.56 
 
 		 343 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 349 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  42.56 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  42.56 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  42.34 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  44.48 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 344 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 389 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  44.13 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.51 
 
 		 343 aa  266  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 343 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  44.21 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 344 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  44.65 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  44.16 
 
 		 346 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  42.5 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  44.05 
 
 		 345 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  41.46 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  42.52 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 326 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  43.45 
 
 		 345 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 345 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  41.82 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  45.64 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  44.06 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  43.08 
 
 		 331 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  41.98 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  40.87 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  41.98 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3237  aldo/keto reductase  43.17 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  43.67 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  42.4 
 
 		 341 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  41.51 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  40.77 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>