More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1954 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  100 
 
 		 349 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  78.57 
 
 		 352 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  78 
 
 		 352 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  73.14 
 
 		 350 aa  535  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  69.14 
 
 		 349 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  65.9 
 
 		 352 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  64.1 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  62.86 
 
 		 354 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  63.48 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  61.74 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  57.6 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  54.15 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  51.65 
 
 		 345 aa  345  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  52.87 
 
 		 344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  52.25 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  52.25 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  51.2 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  51.35 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  50.45 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  51.81 
 
 		 343 aa  325  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  49.42 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 342 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  50 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  48.64 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  48.94 
 
 		 344 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  48.33 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  47.13 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 349 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  48.64 
 
 		 341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  50.76 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  47.58 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  49.85 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  49.1 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  51.05 
 
 		 344 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 349 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 349 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 345 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  49.54 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  49.69 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  46.81 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  48.48 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  48.19 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  48.19 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  48.19 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  47.89 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  46.47 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  48.63 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  48.63 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  48.63 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  49.24 
 
 		 345 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  45.64 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  47.43 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  47.43 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  47.59 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  50 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  45.02 
 
 		 338 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  43.87 
 
 		 358 aa  285  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  47.13 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  46.06 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  47.13 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  46.39 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  47.43 
 
 		 340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  47.93 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  45.76 
 
 		 345 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  45.48 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  46.85 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  46.75 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  43.41 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  45.95 
 
 		 349 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.71 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  42.99 
 
 		 360 aa  268  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  47.42 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  45.35 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  44.75 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 334 aa  265  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  46.15 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  45.48 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  44.78 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  44.48 
 
 		 343 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  44.48 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  43.58 
 
 		 358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  44.62 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  43.95 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  43.87 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  43.54 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  43.84 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  41.1 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  43.57 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 343 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  42.98 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  42.11 
 
 		 327 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.13 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  43.16 
 
 		 324 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>