More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5452 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  100 
 
 
350 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  95.13 
 
 
349 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  86.17 
 
 
349 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  86.17 
 
 
349 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  81.74 
 
 
349 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  78.96 
 
 
348 aa  568  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  75.94 
 
 
346 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  70.71 
 
 
338 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  70.41 
 
 
338 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  68.93 
 
 
338 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  67.75 
 
 
345 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  70.92 
 
 
340 aa  461  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  68.26 
 
 
339 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  68.26 
 
 
339 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  64.22 
 
 
349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  63.34 
 
 
349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  63.61 
 
 
353 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  63.05 
 
 
351 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  62.97 
 
 
351 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  62.68 
 
 
351 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  62.97 
 
 
351 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  62.97 
 
 
370 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  64.07 
 
 
361 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  64.29 
 
 
360 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  56.85 
 
 
358 aa  401  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  59.47 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  56.1 
 
 
378 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  50.75 
 
 
338 aa  359  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
352 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  51.66 
 
 
349 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  47.88 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  47.73 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  45.43 
 
 
355 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  48.19 
 
 
352 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  45.83 
 
 
345 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  47.89 
 
 
352 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  44.7 
 
 
359 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  45.95 
 
 
344 aa  292  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  45.95 
 
 
389 aa  291  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  46.53 
 
 
354 aa  291  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  45.54 
 
 
344 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
344 aa  289  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  45.01 
 
 
351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  47.89 
 
 
352 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
343 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  44.64 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  45.78 
 
 
357 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
343 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  44.35 
 
 
344 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  42.65 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  42.6 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  48.48 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  45.92 
 
 
341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  46.83 
 
 
325 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  45.62 
 
 
342 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
345 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  45.99 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  46.73 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  43.45 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  44.58 
 
 
327 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  42.3 
 
 
344 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  45.54 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  45.54 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  45.54 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
345 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  46.58 
 
 
328 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  44.64 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
344 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  45 
 
 
326 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  43.15 
 
 
344 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
334 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
325 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  42.3 
 
 
349 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  43.88 
 
 
342 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
323 aa  255  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  45.96 
 
 
326 aa  255  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  45.43 
 
 
325 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  43.15 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  42.56 
 
 
342 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  45.37 
 
 
343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  43.11 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  43.41 
 
 
341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  42.26 
 
 
342 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  42.26 
 
 
342 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  43.85 
 
 
326 aa  252  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
326 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  44.95 
 
 
326 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
322 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
326 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
343 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
327 aa  248  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  42.2 
 
 
322 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  44.75 
 
 
346 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  43.32 
 
 
343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  42.24 
 
 
325 aa  246  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  45.11 
 
 
324 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
324 aa  246  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.33 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  43.88 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>