More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3852 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  100 
 
 		 389 aa  796    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  97.38 
 
 		 344 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  100 
 
 		 344 aa  705    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  83.43 
 
 		 343 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  77.03 
 
 		 343 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  70.29 
 
 		 344 aa  488  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  68.9 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  67.15 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  66.86 
 
 		 341 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  65.98 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  63.74 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  62.5 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  62.39 
 
 		 344 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  64.91 
 
 		 349 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  62.76 
 
 		 340 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  60.93 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  62.68 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  59.77 
 
 		 344 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  60.93 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  62.68 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  65.42 
 
 		 343 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  62.39 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  62.68 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  63.86 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  61.52 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  61.52 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  59.77 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  61.52 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  61.22 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  61.81 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  57.02 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  57.02 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  57.89 
 
 		 342 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  54.68 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  54.52 
 
 		 354 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  54.35 
 
 		 352 aa  342  8e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  54.38 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  52.55 
 
 		 350 aa  332  9e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  51.65 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  48.66 
 
 		 359 aa  318  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  50.76 
 
 		 352 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  48.05 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  47.15 
 
 		 352 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  52.25 
 
 		 349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  48.19 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  46.41 
 
 		 357 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  45.95 
 
 		 349 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  46.08 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  46.08 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  45.95 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  43.98 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  44.74 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  46.39 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  46.25 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  46.25 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  44.01 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  45.78 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  44.01 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  45.78 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  45.29 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  44.54 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  44.54 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  44.25 
 
 		 370 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  43.41 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  44.54 
 
 		 351 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 345 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  45.21 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 342 aa  265  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 351 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  39.82 
 
 		 358 aa  262  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  43.77 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  44 
 
 		 343 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  43.41 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  41 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 325 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.12 
 
 		 343 aa  242  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  39.82 
 
 		 360 aa  242  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  40.71 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.37 
 
 		 343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  39.37 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  40.42 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  40.25 
 
 		 343 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  38.81 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  43.17 
 
 		 323 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.08 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  40 
 
 		 322 aa  230  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.73 
 
 		 343 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.94 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  41.88 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.56 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.59 
 
 		 344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 326 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  39.14 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.22 
 
 		 331 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>