More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5127 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  98.26 
 
 		 345 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  93.91 
 
 		 345 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  100 
 
 		 345 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  93.91 
 
 		 345 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  93.91 
 
 		 345 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  92.75 
 
 		 345 aa  630  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  82.46 
 
 		 344 aa  585  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  79.71 
 
 		 345 aa  574  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  80.76 
 
 		 344 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  79.88 
 
 		 344 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  77.97 
 
 		 349 aa  554  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  76.32 
 
 		 344 aa  517  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  76.32 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  76.02 
 
 		 344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  72.17 
 
 		 342 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  74.45 
 
 		 343 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  71.88 
 
 		 342 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  71.88 
 
 		 342 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  76.01 
 
 		 343 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  70.97 
 
 		 341 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  65.98 
 
 		 344 aa  475  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  70.67 
 
 		 341 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  70.09 
 
 		 342 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  69.88 
 
 		 342 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  64.65 
 
 		 340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  63.34 
 
 		 343 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  61.27 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  63.56 
 
 		 344 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  60.87 
 
 		 347 aa  427  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  62.68 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  62.68 
 
 		 344 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  61 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  57.77 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  57.14 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  54.41 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  50.44 
 
 		 354 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  53.64 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  52.34 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  49.55 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  49.85 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  49.7 
 
 		 359 aa  325  8.000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  49.42 
 
 		 350 aa  318  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  46.78 
 
 		 355 aa  318  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  43.66 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  43.7 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 349 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  44.05 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  45.16 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  44.64 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  45.16 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  46.73 
 
 		 350 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  46.13 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  42.23 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  46.2 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  45.67 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  42.52 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  44.15 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  42.98 
 
 		 346 aa  272  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  44.54 
 
 		 338 aa  271  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  44.7 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  44.13 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  43.53 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  45.27 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  44.83 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  44.83 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  43.95 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  43.66 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  46.13 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  43.48 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  43.19 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  45.09 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  43.71 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  43.5 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.45 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  45.05 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  42.68 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.69 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  43.32 
 
 		 344 aa  242  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  42.27 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  44.08 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  40.36 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.44 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  40.48 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  39.58 
 
 		 343 aa  235  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  40.5 
 
 		 322 aa  235  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  40.12 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  40.97 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  41.16 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 323 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  43.33 
 
 		 360 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.798482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>