More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4382 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  100 
 
 
340 aa  686    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  72.11 
 
 
349 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  68.91 
 
 
348 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  69.55 
 
 
349 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  69.55 
 
 
349 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  70.24 
 
 
346 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  69.05 
 
 
345 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  68.96 
 
 
349 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  70.62 
 
 
350 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  68.04 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  68.04 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  68.06 
 
 
338 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  67.16 
 
 
338 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  67.46 
 
 
338 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  61.49 
 
 
361 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  61.42 
 
 
353 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  60.83 
 
 
360 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  60.12 
 
 
342 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  62.8 
 
 
351 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  59.23 
 
 
349 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  62.8 
 
 
351 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  62.5 
 
 
351 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  62.8 
 
 
370 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  62.31 
 
 
351 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  59.23 
 
 
349 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  54.41 
 
 
358 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  52.96 
 
 
338 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
378 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  52.1 
 
 
352 aa  322  8e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  50.3 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  47.81 
 
 
350 aa  305  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  49.1 
 
 
354 aa  302  6.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  44.71 
 
 
339 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
355 aa  288  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  47.31 
 
 
352 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  47.31 
 
 
352 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  47.02 
 
 
341 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
343 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  45.95 
 
 
352 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
351 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  45.51 
 
 
344 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  44.61 
 
 
344 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
343 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  46.58 
 
 
326 aa  275  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
389 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  45.13 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  43.07 
 
 
359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
330 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  44.34 
 
 
326 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  43.24 
 
 
357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
326 aa  268  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  43.2 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
345 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  45.82 
 
 
326 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  43.83 
 
 
326 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  42.57 
 
 
349 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
326 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  47.13 
 
 
349 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
342 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  43.3 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  43.66 
 
 
345 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
326 aa  262  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  45.13 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  45.12 
 
 
331 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  41.87 
 
 
340 aa  261  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  43.89 
 
 
328 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.27 
 
 
325 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  44.19 
 
 
345 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  44.19 
 
 
345 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  44.19 
 
 
345 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
323 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  42.69 
 
 
344 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  44.2 
 
 
325 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
347 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  45.31 
 
 
327 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  44.06 
 
 
326 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  44.65 
 
 
325 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  44.1 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  44.2 
 
 
326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
349 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  45.09 
 
 
345 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  43.29 
 
 
334 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  44.48 
 
 
343 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  45.19 
 
 
335 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  47.06 
 
 
326 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  44.55 
 
 
346 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  42.31 
 
 
344 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
325 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  43.9 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  43.2 
 
 
344 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
349 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  45.34 
 
 
326 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  44.72 
 
 
326 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  44.44 
 
 
327 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.25 
 
 
343 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  43.44 
 
 
337 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  42.23 
 
 
344 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
326 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>