More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4663 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  100 
 
 		 349 aa  713    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  100 
 
 		 349 aa  713    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  86.17 
 
 		 350 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  83.57 
 
 		 349 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  78.96 
 
 		 348 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  78.84 
 
 		 349 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  76.45 
 
 		 346 aa  558  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  69.53 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  68.05 
 
 		 345 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  68.93 
 
 		 338 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  67.75 
 
 		 338 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  67.75 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  67.75 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  69.55 
 
 		 340 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  61.76 
 
 		 353 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  62.68 
 
 		 349 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  63.27 
 
 		 360 aa  434  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  63.93 
 
 		 370 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  63.56 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  63.56 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  61.81 
 
 		 349 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  63.34 
 
 		 351 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  62.17 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  63.34 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  60.06 
 
 		 342 aa  411  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  57.1 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  56.69 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  52.54 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  51.21 
 
 		 352 aa  315  8e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  50.45 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  47.73 
 
 		 350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 352 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  46.04 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  46.97 
 
 		 339 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  47.89 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  46.08 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  46.08 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  45.02 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  46.22 
 
 		 354 aa  288  7e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  45.14 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  45.78 
 
 		 344 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  45.16 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  43.15 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  45.48 
 
 		 357 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 343 aa  282  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  43.11 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  41.42 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  46.93 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 345 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 345 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  42.64 
 
 		 340 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 345 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  45.11 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  41.99 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  42.52 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.71 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  45.16 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  45.77 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  46.56 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  44.54 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  41.94 
 
 		 344 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  44.87 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  42.52 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  43.99 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.64 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  43.7 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  43.15 
 
 		 342 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  43.28 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  43.7 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  46.58 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  42.81 
 
 		 341 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  45.79 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  43.3 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  45.03 
 
 		 343 aa  252  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  45.37 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  45.03 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  44.58 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.87 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  41.05 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  44.34 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  40.18 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  43.61 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.39 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  44.97 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  45.06 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  44.48 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  42.25 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>