More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4437 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  100 
 
 
340 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  70.78 
 
 
342 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  67.06 
 
 
344 aa  481  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  66.96 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  64.12 
 
 
344 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  67.75 
 
 
342 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  65.49 
 
 
341 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  66.08 
 
 
343 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  63.13 
 
 
345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  63.82 
 
 
349 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  62.65 
 
 
344 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  62.94 
 
 
345 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  61.47 
 
 
344 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  64.31 
 
 
343 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  66.67 
 
 
343 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  63.24 
 
 
343 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  61.58 
 
 
347 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  64.65 
 
 
345 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  63.53 
 
 
344 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  64.65 
 
 
345 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  63.53 
 
 
344 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  62.65 
 
 
345 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  63.53 
 
 
344 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  63.75 
 
 
345 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  63.24 
 
 
344 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  63.75 
 
 
345 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  63.75 
 
 
345 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  62.76 
 
 
389 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  62.76 
 
 
344 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  58.82 
 
 
342 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  58.53 
 
 
342 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  58.53 
 
 
342 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  60.24 
 
 
349 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  57.32 
 
 
341 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  51.82 
 
 
354 aa  344  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  51.36 
 
 
352 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  50.91 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
355 aa  325  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  49.55 
 
 
350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
359 aa  311  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  47.27 
 
 
352 aa  309  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  46.55 
 
 
352 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  46.85 
 
 
352 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  43.33 
 
 
351 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  44.11 
 
 
357 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  47.13 
 
 
349 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  42.6 
 
 
350 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  41.99 
 
 
349 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
349 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  40.63 
 
 
378 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  41.09 
 
 
353 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
341 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  40.66 
 
 
348 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  43.07 
 
 
338 aa  255  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  38.99 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  38.74 
 
 
338 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  41.59 
 
 
339 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
339 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  39.76 
 
 
346 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  39.27 
 
 
342 aa  248  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  41.57 
 
 
338 aa  248  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
370 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  40.54 
 
 
351 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
325 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  40.54 
 
 
351 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  40.84 
 
 
351 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  41.09 
 
 
345 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.96 
 
 
344 aa  246  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  39.64 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
340 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.19 
 
 
332 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  39.52 
 
 
339 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
322 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
333 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
343 aa  235  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  38.02 
 
 
349 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
332 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.77 
 
 
321 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
315 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.64 
 
 
343 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.19 
 
 
343 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  38.9 
 
 
343 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
333 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  38.56 
 
 
328 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  37.39 
 
 
361 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  37.83 
 
 
329 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  38.62 
 
 
343 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
315 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  38.75 
 
 
313 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
325 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  39.44 
 
 
334 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
326 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  41.01 
 
 
309 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  38.97 
 
 
343 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>