More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6622 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  100 
 
 
358 aa  739    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  64.14 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  54.93 
 
 
353 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
349 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
349 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  56.69 
 
 
346 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  56.4 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  57.14 
 
 
339 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
339 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  56.85 
 
 
350 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  56.27 
 
 
349 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  55.49 
 
 
351 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  55.49 
 
 
351 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  55.69 
 
 
345 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  55.13 
 
 
351 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  54.81 
 
 
338 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  54.52 
 
 
338 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  52.26 
 
 
349 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  52.54 
 
 
349 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  54.52 
 
 
338 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  53.29 
 
 
361 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  52.68 
 
 
360 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  53.33 
 
 
370 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  52.75 
 
 
351 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  54.41 
 
 
340 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  50.88 
 
 
338 aa  355  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  49.71 
 
 
352 aa  346  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  48.71 
 
 
378 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  45.3 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  45.17 
 
 
350 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
355 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  44.51 
 
 
339 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  42.7 
 
 
352 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  42.98 
 
 
352 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  42.29 
 
 
354 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  43.4 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  40.97 
 
 
351 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  43.45 
 
 
357 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
326 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  41.19 
 
 
352 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  39 
 
 
359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  42.73 
 
 
343 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  42.48 
 
 
343 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
347 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
345 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  41.84 
 
 
343 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  42.73 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.05 
 
 
341 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  41.54 
 
 
344 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  40.76 
 
 
344 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  43.98 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
332 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
344 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  40.47 
 
 
349 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  45.51 
 
 
326 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
335 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  39.23 
 
 
344 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
326 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
389 aa  262  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
326 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  44.61 
 
 
322 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  40.76 
 
 
344 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  42.52 
 
 
345 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  42.34 
 
 
330 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  42.15 
 
 
326 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  42.23 
 
 
345 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
343 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  41.12 
 
 
326 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  41.62 
 
 
328 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  44.62 
 
 
326 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.66 
 
 
343 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  42.73 
 
 
326 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.04 
 
 
343 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  40.48 
 
 
349 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
327 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
326 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3237  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
326 aa  256  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
326 aa  255  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
326 aa  255  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
325 aa  255  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  38.99 
 
 
343 aa  255  9e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  41.44 
 
 
343 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  38.99 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  41.35 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  41.1 
 
 
326 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  41.86 
 
 
329 aa  252  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  42.43 
 
 
326 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
337 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
326 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  45.35 
 
 
324 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
332 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4540  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
332 aa  249  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>