More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6263 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  89.46 
 
 		 351 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  89.46 
 
 		 351 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  100 
 
 		 351 aa  708    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  89.46 
 
 		 351 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  98.58 
 
 		 370 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  65.8 
 
 		 349 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  64.93 
 
 		 349 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  62.14 
 
 		 349 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  63.27 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  64.29 
 
 		 353 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  63.34 
 
 		 349 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  63.34 
 
 		 349 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  62.1 
 
 		 350 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  61.05 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  59.88 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  58.24 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  58.24 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  57.94 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  57.94 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  62.31 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  56.89 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  57.18 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  52.75 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  55.36 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  54.36 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  53.6 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  53.51 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  52.11 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  46.99 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  48.35 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  48.35 
 
 		 352 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  46.85 
 
 		 352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  47.01 
 
 		 352 aa  278  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  46.85 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  43.99 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  43.23 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 389 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.48 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  40.86 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  43.71 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  45.78 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  43.68 
 
 		 344 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  42.49 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  43.93 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  42.49 
 
 		 343 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  46.99 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  43.71 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  41.86 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  42.98 
 
 		 345 aa  255  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  41.81 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  42.2 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  42.98 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  42.47 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  42.98 
 
 		 345 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  42.98 
 
 		 345 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  42.98 
 
 		 345 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.55 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  42.49 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  42.41 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  44.25 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  44.25 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  43.95 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  41.62 
 
 		 345 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  43.62 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  42.32 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.88 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  41.91 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.22 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  39.64 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 343 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  43.56 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  40.37 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.66 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  43.83 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  39.17 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  39.02 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.04 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  43.12 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  43.49 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  44.48 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  41.72 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  42.2 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  40.84 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  42.03 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  40.52 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  39.38 
 
 		 317 aa  230  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>