More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7100 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  93.66 
 
 
331 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  100 
 
 
331 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  80.97 
 
 
331 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  71.65 
 
 
332 aa  484  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  66.27 
 
 
336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  46.77 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.12 
 
 
343 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  43.47 
 
 
325 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  43.07 
 
 
370 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
334 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  41.79 
 
 
351 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  41.79 
 
 
351 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  45.16 
 
 
329 aa  256  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  41.79 
 
 
351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
343 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  42.73 
 
 
339 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  42.73 
 
 
339 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
341 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
349 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
349 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  43.5 
 
 
352 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  42.6 
 
 
353 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  43.38 
 
 
343 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  41.62 
 
 
346 aa  245  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  42.34 
 
 
338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  40.95 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  42.15 
 
 
343 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  42.15 
 
 
343 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.38 
 
 
335 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
340 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  41.8 
 
 
349 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.02 
 
 
344 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
332 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  42.19 
 
 
322 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  42.34 
 
 
338 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  43.48 
 
 
333 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  41.54 
 
 
349 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
349 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
349 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
338 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  38.32 
 
 
327 aa  238  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
323 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  42.33 
 
 
326 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
326 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  40.71 
 
 
348 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
323 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  41.05 
 
 
326 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
350 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  41.8 
 
 
337 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
355 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  38.95 
 
 
338 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1354  aldo/keto reductase  39.23 
 
 
338 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0700242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
315 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
358 aa  235  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  40.92 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1363  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197113  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  43.33 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  40.5 
 
 
315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  41.62 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  41.62 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  42.26 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
340 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  40.88 
 
 
325 aa  232  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.74 
 
 
332 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  40.36 
 
 
350 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
338 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  39.76 
 
 
345 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
322 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
313 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  40.76 
 
 
322 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  40.8 
 
 
326 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  43.43 
 
 
337 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
326 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  38.02 
 
 
342 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  42.42 
 
 
344 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  40.36 
 
 
343 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  42.31 
 
 
324 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  40.56 
 
 
334 aa  228  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
326 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
333 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
333 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
336 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
346 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  41.1 
 
 
322 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
326 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  43.52 
 
 
335 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  39.7 
 
 
342 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.57 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
332 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
323 aa  225  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
323 aa  225  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  41.32 
 
 
326 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  39.76 
 
 
343 aa  225  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>