More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5855 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  100 
 
 
320 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  88.58 
 
 
324 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  72.73 
 
 
320 aa  454  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  65.08 
 
 
316 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  63.86 
 
 
325 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  64.01 
 
 
322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  62.22 
 
 
317 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  64.97 
 
 
316 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  62.62 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  62.74 
 
 
317 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  61.98 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  62.94 
 
 
320 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  64.65 
 
 
316 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  59.31 
 
 
317 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  59.55 
 
 
321 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  60.51 
 
 
313 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  61.15 
 
 
315 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  58.6 
 
 
317 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  60.83 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  60.95 
 
 
326 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  61.51 
 
 
316 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  61.41 
 
 
323 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  61.71 
 
 
318 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  59.55 
 
 
316 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  57.01 
 
 
314 aa  368  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  57.32 
 
 
315 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  59.87 
 
 
314 aa  364  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  59.24 
 
 
313 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  57.01 
 
 
315 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  56.01 
 
 
315 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.41 
 
 
315 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.41 
 
 
334 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.41 
 
 
334 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.41 
 
 
334 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.41 
 
 
334 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  58.1 
 
 
316 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
315 aa  348  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.1 
 
 
331 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.41 
 
 
463 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.83 
 
 
315 aa  345  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  54.14 
 
 
315 aa  344  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  56.51 
 
 
315 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  56.51 
 
 
315 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  56.83 
 
 
315 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  56.19 
 
 
315 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  55.87 
 
 
315 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  55.87 
 
 
315 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  52.7 
 
 
311 aa  338  8e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  53.33 
 
 
314 aa  325  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  54.95 
 
 
321 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  55.63 
 
 
318 aa  315  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  54.95 
 
 
321 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  54.63 
 
 
321 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  52.56 
 
 
312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  47.62 
 
 
338 aa  288  6e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  50 
 
 
342 aa  285  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  48.44 
 
 
329 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  53.5 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  46.75 
 
 
325 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  54.87 
 
 
307 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  51.62 
 
 
315 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  51.77 
 
 
318 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  49.35 
 
 
305 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  45.71 
 
 
323 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
341 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.51 
 
 
335 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  43.08 
 
 
333 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  42.55 
 
 
349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  42.34 
 
 
353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  42.21 
 
 
333 aa  215  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.54 
 
 
332 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
324 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
331 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  41.1 
 
 
327 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.51 
 
 
331 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.9 
 
 
344 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
338 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
338 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  39.81 
 
 
324 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
324 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.81 
 
 
324 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
324 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
326 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  41.12 
 
 
313 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  39.81 
 
 
324 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.51 
 
 
324 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.81 
 
 
324 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.81 
 
 
324 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  42.44 
 
 
309 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
338 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.81 
 
 
324 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2245  aldo/keto reductase  39.6 
 
 
353 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  39.09 
 
 
349 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
313 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
313 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2755  aldo/keto reductase  39.6 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  38.79 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>