More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1314 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  100 
 
 
321 aa  651    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  94.39 
 
 
321 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  71.96 
 
 
321 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  72.41 
 
 
320 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  71.2 
 
 
317 aa  454  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  66.35 
 
 
322 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  63.38 
 
 
317 aa  401  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  65.19 
 
 
316 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  62.3 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  64.56 
 
 
316 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  63.78 
 
 
315 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  63.78 
 
 
313 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  64.01 
 
 
318 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  62.1 
 
 
314 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  62.62 
 
 
320 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
326 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  60.26 
 
 
316 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  63.87 
 
 
323 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  62.82 
 
 
313 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  62.18 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  60.38 
 
 
320 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.3 
 
 
315 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.3 
 
 
463 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.98 
 
 
315 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  58.81 
 
 
324 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.3 
 
 
334 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.3 
 
 
334 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.98 
 
 
331 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.3 
 
 
334 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.3 
 
 
334 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
311 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  57.32 
 
 
317 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
316 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  59.49 
 
 
314 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  61.02 
 
 
315 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
315 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
315 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  61.02 
 
 
315 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
315 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
315 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  57.51 
 
 
316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  56.09 
 
 
315 aa  348  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  55.45 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  54.17 
 
 
315 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  54.14 
 
 
316 aa  323  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  51.92 
 
 
315 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
315 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  53.67 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  53.21 
 
 
321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  53.85 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  52.67 
 
 
318 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  52.41 
 
 
321 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  51.13 
 
 
312 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  45.4 
 
 
338 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  54.1 
 
 
307 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  51.6 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  45.28 
 
 
329 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  44.17 
 
 
342 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  44.83 
 
 
325 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  48.54 
 
 
305 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  47.28 
 
 
323 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
318 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  46.69 
 
 
315 aa  241  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  38.3 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.78 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
309 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.54 
 
 
333 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
331 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
317 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
333 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
350 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
331 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.2 
 
 
331 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  40.82 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  39.2 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  39.2 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  38.27 
 
 
335 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
327 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  38.7 
 
 
343 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
343 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
352 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  36.92 
 
 
345 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  37.8 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  38.83 
 
 
320 aa  189  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  38.68 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
355 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  37.77 
 
 
343 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
313 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  39.2 
 
 
317 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  36.65 
 
 
334 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  36.69 
 
 
327 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
313 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
343 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  36.71 
 
 
358 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.77 
 
 
343 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  38.79 
 
 
344 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  39.41 
 
 
328 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
349 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>