More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3931 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  100 
 
 		 313 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  87.54 
 
 		 313 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  87.54 
 
 		 313 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  76.85 
 
 		 313 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  59.55 
 
 		 320 aa  355  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  53.46 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  53.48 
 
 		 317 aa  318  7e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  53.04 
 
 		 317 aa  316  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  54.26 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  53.97 
 
 		 325 aa  315  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  52.55 
 
 		 319 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  52.68 
 
 		 316 aa  311  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  51.77 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  52.85 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  52.37 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  50.64 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50.94 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  50.63 
 
 		 321 aa  288  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13010  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  49.69 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  49.36 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  46.37 
 
 		 317 aa  272  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3670  aldo/keto reductase  44.79 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  46.18 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  43.99 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  44.65 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  43.52 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  43.85 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  42.36 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  43.3 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  43.62 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  39.88 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  40.31 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  47.24 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  40.92 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  41.18 
 
 		 331 aa  235  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.9 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  39.81 
 
 		 349 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 344 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  39.88 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  43.31 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  40.88 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  42.01 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 345 aa  232  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  40.57 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  40.69 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  42.22 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  41.72 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  41.38 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  40.19 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  42.15 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4540  aldo/keto reductase  39.69 
 
 		 332 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  40.37 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.09 
 
 		 343 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  42.19 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  40.68 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  43.17 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  41.51 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  42.23 
 
 		 349 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  40 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  43.12 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  40.56 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  40.56 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  40.71 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  42.68 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  41.03 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  41.03 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  40.25 
 
 		 344 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 345 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  41.16 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  38.91 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.81 
 
 		 343 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  41.18 
 
 		 352 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  40 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  43.29 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  38.75 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  39.08 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  40.74 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  39.25 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  39.88 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  46.08 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  41.19 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  40.63 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  40.55 
 
 		 349 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  37.54 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>