More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3437 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  100 
 
 		 318 aa  630  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  53.82 
 
 		 315 aa  328  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  55 
 
 		 322 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  54.11 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  55.1 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  52.06 
 
 		 316 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  52.37 
 
 		 317 aa  311  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  52.06 
 
 		 315 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  50.96 
 
 		 314 aa  308  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  49.84 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  49.68 
 
 		 317 aa  305  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  51.75 
 
 		 313 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  50.96 
 
 		 321 aa  302  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  49.84 
 
 		 321 aa  301  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  52.67 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  55.31 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  54.26 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  49.52 
 
 		 317 aa  299  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  50.32 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  48.42 
 
 		 317 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  51.59 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  49.84 
 
 		 313 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  49.84 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  52.2 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  50.79 
 
 		 325 aa  289  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.48 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.48 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.48 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.48 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.48 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  50 
 
 		 315 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.16 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.48 
 
 		 463 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.84 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  50.66 
 
 		 316 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  50.33 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  46.35 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  49.2 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  47.13 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  50.79 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  48.88 
 
 		 315 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  49.04 
 
 		 316 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  48.56 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  50.64 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  48.25 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  48.25 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  48.56 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  47.94 
 
 		 315 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  47.94 
 
 		 315 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  50.79 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  50.79 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  50 
 
 		 312 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  46.15 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  49.04 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  46.34 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  48.71 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  45.62 
 
 		 338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  48.7 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  49.13 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  48.86 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  40.81 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  44.79 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  44.01 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  39.69 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.12 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  38.05 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  38.34 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  37.93 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  38.15 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  37.69 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  38.36 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  36.83 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  37.93 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  37.72 
 
 		 344 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  35.47 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  36.04 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  35.17 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  37.17 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  36.47 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  37.16 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  34.38 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  37.88 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4803  aldo/keto reductase  36.78 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  35.12 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  34.85 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  37.23 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4424  aldo/keto reductase  34.02 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00178858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  37.84 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  37.06 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  34.66 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3284  aldo/keto reductase  37.27 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  37.16 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  34.94 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  36.11 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  34.35 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  35.56 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>