More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5334 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  100 
 
 
324 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  88.58 
 
 
320 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  71.83 
 
 
320 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  62.31 
 
 
316 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  62.19 
 
 
325 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
320 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  59.43 
 
 
321 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  60.82 
 
 
322 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  58.81 
 
 
321 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  60.5 
 
 
317 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  61.13 
 
 
316 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  57.81 
 
 
317 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  60.82 
 
 
316 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  58.93 
 
 
313 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  59.25 
 
 
313 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  57.55 
 
 
321 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  59.56 
 
 
315 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  60.32 
 
 
323 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  58.31 
 
 
316 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  59.5 
 
 
318 aa  363  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  58.62 
 
 
314 aa  361  8e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  57.99 
 
 
313 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  56.11 
 
 
317 aa  360  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  58.62 
 
 
326 aa  358  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  56.11 
 
 
317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  59.01 
 
 
316 aa  355  7.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  56.11 
 
 
315 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  56.11 
 
 
315 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  54.23 
 
 
314 aa  347  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
315 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.25 
 
 
315 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.62 
 
 
315 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.25 
 
 
334 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.25 
 
 
334 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.25 
 
 
334 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.25 
 
 
334 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  54.37 
 
 
315 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.94 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  55.31 
 
 
315 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  53.73 
 
 
315 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  55 
 
 
315 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  55 
 
 
315 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.25 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  56.25 
 
 
316 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  54.69 
 
 
315 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  53.75 
 
 
315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  53.75 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  48.91 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  55.19 
 
 
314 aa  311  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  54.43 
 
 
321 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  54.75 
 
 
321 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  55.84 
 
 
318 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  53.48 
 
 
321 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  51.1 
 
 
312 aa  295  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  48.94 
 
 
338 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  56.09 
 
 
307 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  49.23 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  51.22 
 
 
342 aa  281  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  53.26 
 
 
314 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
315 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  49.52 
 
 
305 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  47.02 
 
 
323 aa  258  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  42.17 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
333 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  42.58 
 
 
333 aa  225  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.28 
 
 
343 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
335 aa  218  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  42.59 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  40.32 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
336 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.27 
 
 
332 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  41.05 
 
 
313 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
340 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.57 
 
 
331 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.9 
 
 
353 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
313 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1755  aldo/keto reductase  41.8 
 
 
330 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.57 
 
 
331 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
313 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
358 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  43.03 
 
 
341 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  37.91 
 
 
338 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2120  aldo/keto reductase  41.8 
 
 
330 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  39.46 
 
 
351 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  39.46 
 
 
351 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1837  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
330 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
338 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
324 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  41.57 
 
 
338 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  42.31 
 
 
352 aa  202  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  39.46 
 
 
351 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
325 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  38.25 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  38.72 
 
 
326 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
349 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>