More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5044 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  100 
 
 		 316 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  60.88 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  57.23 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  58.7 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  53.65 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  55.41 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  53.97 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  55.87 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  53.21 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  54.14 
 
 		 321 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  53.5 
 
 		 315 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  52.23 
 
 		 315 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  50 
 
 		 317 aa  325  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  52.56 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  52.55 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  54.29 
 
 		 315 aa  322  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  50.96 
 
 		 315 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  53.65 
 
 		 316 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  53.8 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  52.85 
 
 		 316 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  51.59 
 
 		 313 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  54.17 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  51.28 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  52.55 
 
 		 313 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  53.18 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  50.32 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  50.96 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  50.64 
 
 		 315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  49.36 
 
 		 321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  53.16 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  52.26 
 
 		 323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  49.68 
 
 		 314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  49.68 
 
 		 317 aa  301  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  50.16 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  50.16 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  50.16 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  50.48 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  49.52 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  51.92 
 
 		 321 aa  289  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.84 
 
 		 315 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.84 
 
 		 334 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.84 
 
 		 334 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.84 
 
 		 334 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.84 
 
 		 334 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  50.32 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  50.32 
 
 		 315 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  50.32 
 
 		 315 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.52 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.89 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  51.92 
 
 		 321 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.84 
 
 		 463 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  50.64 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  49.83 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  46.48 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  46.6 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  46.48 
 
 		 342 aa  258  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  49.02 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  48.25 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  49.01 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  46.62 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  44.23 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  42.72 
 
 		 305 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.46 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  40.68 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  40.6 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1125  aldo/keto reductase  37.75 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  40.19 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  38.48 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  37.89 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  38.26 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  38.01 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  39.57 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  37.54 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3664  aldo/keto reductase  36.18 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.160957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  35.69 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.54 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  36.25 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0511  aldo/keto reductase  35.34 
 
 		 356 aa  178  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  42.05 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1279  aldo/keto reductase  34.73 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0530409  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1363  aldo/keto reductase  35.56 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  37 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.28 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  38.65 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  37.22 
 
 		 313 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  36.88 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  39.01 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  36.5 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  37.67 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  36.65 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  38.15 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  37.65 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  37 
 
 		 349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  33.92 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  36.73 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  36.74 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  38.39 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>