More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0788 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  100 
 
 
315 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  68.79 
 
 
315 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  59.11 
 
 
322 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  58.73 
 
 
316 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
325 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  56.19 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  55.7 
 
 
320 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  55.7 
 
 
314 aa  348  7e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  54.43 
 
 
317 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  56.41 
 
 
315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  57.14 
 
 
316 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  52.7 
 
 
316 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  56.83 
 
 
316 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  52.87 
 
 
314 aa  339  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  53.97 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  52.87 
 
 
317 aa  338  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  54.14 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  54.17 
 
 
321 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  53.04 
 
 
320 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  54.63 
 
 
326 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  54.37 
 
 
324 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  53.53 
 
 
321 aa  331  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.48 
 
 
315 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  52.7 
 
 
313 aa  329  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  53.02 
 
 
313 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  53.33 
 
 
313 aa  328  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.11 
 
 
331 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.8 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.8 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.8 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.8 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.8 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.8 
 
 
463 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  53.82 
 
 
318 aa  324  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  51.9 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  53.85 
 
 
323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  50 
 
 
311 aa  319  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  51.76 
 
 
321 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  52.22 
 
 
315 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  51.58 
 
 
315 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  51.58 
 
 
315 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  51.27 
 
 
315 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  50.63 
 
 
315 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  51.27 
 
 
315 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  51.27 
 
 
315 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  51.27 
 
 
316 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  50.64 
 
 
316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  50.99 
 
 
318 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  52.09 
 
 
321 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  52.41 
 
 
321 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  53.05 
 
 
321 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
314 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  47.92 
 
 
312 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  51.05 
 
 
314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  45.73 
 
 
342 aa  272  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  45.12 
 
 
338 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  52.12 
 
 
307 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  44.51 
 
 
329 aa  257  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  49.82 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  46.73 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  46.38 
 
 
323 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  45.4 
 
 
305 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.3 
 
 
325 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.19 
 
 
332 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
331 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.74 
 
 
331 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  43.03 
 
 
335 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
336 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  39.05 
 
 
325 aa  208  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
333 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
309 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
334 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
333 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  38.74 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  43.16 
 
 
352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
332 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  38.63 
 
 
360 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
345 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
346 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  37.99 
 
 
344 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
349 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  36.96 
 
 
324 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
338 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  38.63 
 
 
326 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
327 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  39.46 
 
 
352 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
326 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  38.36 
 
 
326 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  38.84 
 
 
331 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
326 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  38.21 
 
 
351 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  38.21 
 
 
351 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
325 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
353 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0460  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.56 
 
 
324 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
338 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>