More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03274 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  100 
 
 
323 aa  646    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  76.58 
 
 
318 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  64.4 
 
 
322 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  63.9 
 
 
321 aa  391  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  62.1 
 
 
317 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  62.1 
 
 
320 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  62.1 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  62.54 
 
 
313 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  63.9 
 
 
321 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.74 
 
 
315 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  60 
 
 
325 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.74 
 
 
315 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  60.19 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  61.71 
 
 
317 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.74 
 
 
334 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.74 
 
 
334 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.42 
 
 
331 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.74 
 
 
334 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.74 
 
 
334 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.74 
 
 
463 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  60.83 
 
 
321 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  59.81 
 
 
326 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
314 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  62.1 
 
 
315 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  60.88 
 
 
315 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  61.34 
 
 
315 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  60.88 
 
 
315 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  61.02 
 
 
315 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  60.88 
 
 
315 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  61.02 
 
 
320 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
324 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
315 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  57.96 
 
 
314 aa  363  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  60.38 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  58.15 
 
 
316 aa  361  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  58.15 
 
 
317 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  60.95 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  61.27 
 
 
316 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  60.63 
 
 
316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  57.23 
 
 
311 aa  350  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  55.41 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  57.64 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  55.06 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  54.46 
 
 
315 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  53.8 
 
 
315 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  53.85 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  52.68 
 
 
317 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  52.4 
 
 
316 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  51.28 
 
 
321 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  52.88 
 
 
314 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  51.46 
 
 
318 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  51.28 
 
 
321 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  49.19 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
321 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  47.85 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  47.53 
 
 
323 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  51.04 
 
 
314 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  53.27 
 
 
307 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  46.97 
 
 
342 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  46.03 
 
 
329 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  48.4 
 
 
305 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.37 
 
 
325 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  45.89 
 
 
315 aa  252  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  46.73 
 
 
318 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
333 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
333 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.16 
 
 
341 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
331 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
336 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
332 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
344 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.04 
 
 
331 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  36.61 
 
 
358 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
335 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
331 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  36.31 
 
 
345 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4794  aldo/keto reductase  37.32 
 
 
358 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  39.16 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  39.7 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
350 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  39.02 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  38.11 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  38.25 
 
 
323 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  36.78 
 
 
353 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  36.2 
 
 
334 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  37.27 
 
 
344 aa  180  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  35.09 
 
 
327 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  35.87 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1120  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
348 aa  179  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00427173  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  36.67 
 
 
326 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1125  aldo/keto reductase  38.6 
 
 
351 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
352 aa  179  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  38.65 
 
 
349 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
355 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  38.91 
 
 
352 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
349 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  34.01 
 
 
350 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
333 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  38.18 
 
 
334 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>