More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0151 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  100 
 
 		 317 aa  651    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  68.04 
 
 		 315 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  67.62 
 
 		 315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  61.34 
 
 		 316 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  59.31 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  57.73 
 
 		 322 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  57.78 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  58.99 
 
 		 314 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  57.69 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  54.75 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  55.38 
 
 		 317 aa  348  9e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  56.78 
 
 		 313 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  54.43 
 
 		 313 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  56.01 
 
 		 320 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  55.24 
 
 		 315 aa  342  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  55.45 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  52.55 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  56.11 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  53.94 
 
 		 317 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  54.43 
 
 		 313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  54.75 
 
 		 315 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.84 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.84 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.84 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.84 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.84 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.84 
 
 		 463 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  55.45 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.52 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  55.41 
 
 		 316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  56.65 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  54.17 
 
 		 314 aa  335  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.21 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  52.87 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  55.7 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  53.33 
 
 		 314 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  54.72 
 
 		 315 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  53.63 
 
 		 315 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  54.4 
 
 		 315 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  54.4 
 
 		 315 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  51.9 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  53.31 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  52.72 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  53 
 
 		 315 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  52.37 
 
 		 315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  52.22 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  51.46 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  50.32 
 
 		 321 aa  308  9e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  52.92 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  49.84 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  47.94 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  44.07 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  47.94 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  45.98 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  47.75 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  47.4 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  43.97 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  40.5 
 
 		 325 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  42.26 
 
 		 305 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  42.53 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  42.62 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  39.24 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  38.18 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  40.58 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  37.96 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  37.65 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  38.39 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1363  aldo/keto reductase  34.88 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  37.83 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  38.2 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  40.51 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  36.98 
 
 		 333 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  36.97 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  36.09 
 
 		 331 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1354  aldo/keto reductase  35.52 
 
 		 338 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0700242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  37.99 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  37.27 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  34.86 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  35.69 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  36.09 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  37.61 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  35.69 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1125  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  34.95 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  36.28 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  36.28 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  36.04 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  35.81 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  34.06 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  36.2 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  35.8 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  35.42 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  34.69 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  35.26 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  36.84 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>