More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6256 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  100 
 
 
334 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  69.7 
 
 
323 aa  474  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0084  aldo/keto reductase  67.88 
 
 
328 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0322052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4538  aldo/keto reductase  67.58 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.835863  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0112  aldo/keto reductase  68.79 
 
 
323 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8885  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  67.58 
 
 
322 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1976  aldo/keto reductase  67.88 
 
 
323 aa  435  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2127  aldo/keto reductase  64.24 
 
 
323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0264  aldo/keto reductase  62.12 
 
 
323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  61.98 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0490  aldo/keto reductase  62.73 
 
 
323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.828014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3318  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
327 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0621997 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4803  aldo/keto reductase  59.23 
 
 
329 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0823  aldo/keto reductase  60.24 
 
 
322 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4717  aldo/keto reductase  56.97 
 
 
328 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2595  aldo/keto reductase  59.28 
 
 
325 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2120  aldo/keto reductase  57.86 
 
 
330 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1755  aldo/keto reductase  57.57 
 
 
330 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1837  aldo/keto reductase  57.27 
 
 
330 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2035  aldo/keto reductase  58.52 
 
 
341 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  hitchhiker  0.000622322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  55.95 
 
 
328 aa  358  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  42.69 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  42.15 
 
 
333 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  43.69 
 
 
341 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  43.07 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
325 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
326 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
332 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  41.32 
 
 
327 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.17 
 
 
335 aa  222  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  42.69 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
343 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
338 aa  219  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
343 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  43.34 
 
 
336 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  41.79 
 
 
338 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  40 
 
 
349 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
326 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
343 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  41.23 
 
 
339 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
339 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  39.32 
 
 
332 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
331 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
349 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
349 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  40 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
331 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
341 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  45.03 
 
 
342 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.44 
 
 
331 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
344 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
345 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
326 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  38.62 
 
 
326 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  42.25 
 
 
340 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  38.77 
 
 
326 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
340 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  39.4 
 
 
360 aa  208  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
349 aa  208  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.19 
 
 
343 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  38.65 
 
 
325 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
354 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  39.14 
 
 
337 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
349 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
338 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  38.27 
 
 
351 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  37.9 
 
 
349 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
326 aa  205  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  38.23 
 
 
337 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
350 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  40.35 
 
 
332 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  38.3 
 
 
355 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
345 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
326 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  39.22 
 
 
349 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  38.91 
 
 
352 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  39.57 
 
 
331 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  36.65 
 
 
342 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
338 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.06 
 
 
343 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.64 
 
 
327 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
344 aa  202  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  39.26 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>