More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4538 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4538  aldo/keto reductase  100 
 
 		 323 aa  660    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.835863  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0084  aldo/keto reductase  94.12 
 
 		 328 aa  616  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0322052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  73.37 
 
 		 323 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1976  aldo/keto reductase  75.85 
 
 		 323 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0112  aldo/keto reductase  72.14 
 
 		 323 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8885  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  71.52 
 
 		 322 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  67.58 
 
 		 334 aa  467  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4803  aldo/keto reductase  68.69 
 
 		 329 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1755  aldo/keto reductase  69.39 
 
 		 330 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2120  aldo/keto reductase  70 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1837  aldo/keto reductase  69.09 
 
 		 330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  65.65 
 
 		 328 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  65.5 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0264  aldo/keto reductase  67.28 
 
 		 323 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0490  aldo/keto reductase  67.28 
 
 		 323 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.828014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0823  aldo/keto reductase  66.87 
 
 		 322 aa  421  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3318  aldo/keto reductase  61.77 
 
 		 327 aa  414  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0621997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2127  aldo/keto reductase  66.67 
 
 		 323 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2595  aldo/keto reductase  64.53 
 
 		 325 aa  401  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4717  aldo/keto reductase  59.76 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2035  aldo/keto reductase  56.59 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  hitchhiker  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  46.89 
 
 		 333 aa  268  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  47.99 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  46.23 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  44.72 
 
 		 333 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  42.42 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  43.26 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 340 aa  235  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  44.2 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  42.14 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  44.65 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  42.37 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  40.53 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  44.27 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  41.98 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  44.27 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  42.25 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  42.69 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  39.39 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  41.34 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  42.3 
 
 		 338 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  40.49 
 
 		 326 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  40.48 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  40.5 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  40.18 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  40.18 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  41.8 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  42.64 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  41.43 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  39.57 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  41.36 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.42 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  42.64 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.82 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  39.14 
 
 		 349 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  41.36 
 
 		 352 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  40.24 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  41.52 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  39.77 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  41.52 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  42.24 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  39.77 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  40 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.52 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.52 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  41.61 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  40.12 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  38.96 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  41.61 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.61 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  43.26 
 
 		 342 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  40.85 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  41.05 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 344 aa  215  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  42.64 
 
 		 348 aa  215  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  39.94 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  42.32 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2963  aldo/keto reductase  41.62 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.947943 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  41.11 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  41.88 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.49 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  38.42 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  39.64 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  40.91 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  40.79 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>