More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0296 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  100 
 
 
338 aa  701    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  59.7 
 
 
332 aa  411  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  58.91 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  57.7 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  46.56 
 
 
343 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  46.35 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  45.71 
 
 
341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  42.56 
 
 
368 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  43.96 
 
 
349 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
345 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
343 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  44.97 
 
 
340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
348 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  45.03 
 
 
342 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  44.92 
 
 
349 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
339 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
339 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
339 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  39.46 
 
 
358 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
339 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
344 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
328 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  42.11 
 
 
341 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
344 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
344 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
334 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
327 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  40.65 
 
 
325 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
352 aa  222  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  41.56 
 
 
323 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  40.58 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  40.12 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  41.02 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
354 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  41.54 
 
 
344 aa  219  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
352 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  39.64 
 
 
326 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  40.45 
 
 
349 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
334 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
342 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  38.56 
 
 
353 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1976  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
323 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
355 aa  215  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  40.92 
 
 
345 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  41.19 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.26 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0823  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  38.79 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
346 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2035  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
341 aa  212  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  hitchhiker  0.000622322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0085  putative norsolorinic acid reductase  39.75 
 
 
348 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  38.01 
 
 
334 aa  212  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  38.55 
 
 
353 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  37.95 
 
 
326 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
343 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
326 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  41.38 
 
 
325 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  38.54 
 
 
326 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
325 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  38.99 
 
 
333 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
323 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
317 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  40.51 
 
 
349 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
342 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
328 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
326 aa  209  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  40.44 
 
 
335 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  38.02 
 
 
323 aa  209  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  38.85 
 
 
326 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
335 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3318  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
327 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0621997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  41.01 
 
 
326 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  36.71 
 
 
331 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  36.09 
 
 
348 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
349 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
330 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4538  aldo/keto reductase  42.24 
 
 
323 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.835863  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  38.39 
 
 
324 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  38.96 
 
 
326 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  39.24 
 
 
353 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  40.6 
 
 
322 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1837  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
330 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  38.3 
 
 
338 aa  205  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  39.55 
 
 
326 aa  205  7e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  38.82 
 
 
326 aa  205  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
335 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  39.48 
 
 
326 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
332 aa  205  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  37.89 
 
 
326 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.36 
 
 
315 aa  205  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1189  aldo/keto reductase  37.58 
 
 
349 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.712785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>