More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3784 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  100 
 
 
342 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  68.55 
 
 
343 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  68.48 
 
 
343 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  63.93 
 
 
341 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  64.09 
 
 
340 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
343 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  62.39 
 
 
345 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  59.29 
 
 
344 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  60.36 
 
 
341 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  59.71 
 
 
349 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
348 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  59.64 
 
 
344 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  57.02 
 
 
349 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  56.73 
 
 
345 aa  362  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  56.6 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  59.23 
 
 
341 aa  352  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  55.23 
 
 
344 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  53.57 
 
 
339 aa  346  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  55.43 
 
 
344 aa  345  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  54.52 
 
 
348 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  53.69 
 
 
357 aa  340  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  52.68 
 
 
339 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  52.68 
 
 
339 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  52.38 
 
 
339 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
339 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
333 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  50.63 
 
 
333 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  47.34 
 
 
332 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  45.03 
 
 
338 aa  247  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.14 
 
 
341 aa  242  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  44.06 
 
 
313 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
325 aa  242  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  43.15 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
313 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  43.67 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  41.67 
 
 
334 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  39.66 
 
 
349 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
337 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
317 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
313 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
319 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  41.37 
 
 
335 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  39.88 
 
 
336 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
349 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.6 
 
 
332 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  43.58 
 
 
336 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
349 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
349 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
323 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  43.51 
 
 
309 aa  225  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
339 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
359 aa  225  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  44.16 
 
 
328 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
315 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
335 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
349 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
349 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
342 aa  222  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
349 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  45.03 
 
 
334 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  41.94 
 
 
340 aa  222  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  41.12 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  38.72 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  39.45 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  41.09 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  40.69 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  40.69 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  40.56 
 
 
344 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.29 
 
 
315 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  43.3 
 
 
335 aa  219  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  40.56 
 
 
389 aa  219  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  40.88 
 
 
333 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
332 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.72 
 
 
335 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1976  aldo/keto reductase  44.2 
 
 
323 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  40.88 
 
 
344 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
326 aa  217  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
352 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
337 aa  217  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
350 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  39.34 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  40.29 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  39.78 
 
 
351 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  40.58 
 
 
337 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  41.93 
 
 
326 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  40.26 
 
 
339 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.32 
 
 
322 aa  215  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  38.89 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  38.67 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  40.29 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
353 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  41.58 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  39.2 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>