More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3074 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  100 
 
 		 333 aa  679    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  90.06 
 
 		 333 aa  627  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  68.07 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  57.7 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  49.22 
 
 		 343 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  51.08 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  51.24 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  48.77 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  50.63 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  49.53 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  46.69 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  44.86 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  44.91 
 
 		 349 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  46.2 
 
 		 349 aa  269  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  48.58 
 
 		 343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  47.35 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  44.97 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  46.91 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  45.16 
 
 		 349 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  46.77 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  47.83 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  45.85 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  44.69 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.62 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  42.39 
 
 		 336 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4538  aldo/keto reductase  46.89 
 
 		 323 aa  258  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.835863  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  45.82 
 
 		 335 aa  257  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  47.95 
 
 		 342 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  45.66 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  44.86 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  44.34 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  46.47 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0084  aldo/keto reductase  46.58 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0322052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  43.93 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  44.27 
 
 		 349 aa  255  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  43.34 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  43.88 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  42.41 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  45.4 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  43.73 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  43.77 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  45.63 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  44.69 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  44.87 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  44.03 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  44.03 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  44.03 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  43.48 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1837  aldo/keto reductase  45.78 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1755  aldo/keto reductase  46.69 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  42.63 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  40.43 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  45.29 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  42.46 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  42.44 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 326 aa  247  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  43.04 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2120  aldo/keto reductase  45.48 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3842  aldo/keto reductase  44.87 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  41.88 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4526  aldo/keto reductase  44.87 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  41.82 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  42.14 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  42.44 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1976  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3956  aldo/keto reductase  43.54 
 
 		 326 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4419  aldo/keto reductase  43.58 
 
 		 326 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  42.72 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  43.55 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  46.15 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  41.39 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  44.27 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0823  aldo/keto reductase  44.97 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5778  aldo/keto reductase  44.55 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  43.4 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  41.19 
 
 		 326 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  41.09 
 
 		 335 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  41.94 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  44.23 
 
 		 326 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  44.37 
 
 		 346 aa  241  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  43.91 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  42.02 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  40.95 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  43.45 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  41.98 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  43.37 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  43.59 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  44.56 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  43.37 
 
 		 343 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>