More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1313 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  100 
 
 
337 aa  686    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  86.35 
 
 
342 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  76.49 
 
 
336 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  71.69 
 
 
337 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  71.9 
 
 
336 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  70.09 
 
 
339 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  65.56 
 
 
334 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  64.74 
 
 
349 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  64.95 
 
 
341 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  63.25 
 
 
349 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  62.16 
 
 
339 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  62.76 
 
 
335 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  62.02 
 
 
353 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  63.06 
 
 
335 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  61.01 
 
 
335 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60.48 
 
 
335 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  61.86 
 
 
335 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  59.34 
 
 
337 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  58.98 
 
 
336 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  58.38 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  57.78 
 
 
336 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
333 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  59.64 
 
 
359 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  61.45 
 
 
332 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  57.83 
 
 
342 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  47.32 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  46.69 
 
 
333 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  46.3 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  45.66 
 
 
322 aa  252  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
343 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
327 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  44.14 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  41.9 
 
 
334 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  43.57 
 
 
352 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  43.49 
 
 
333 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
340 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
351 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  45.61 
 
 
333 aa  235  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  42.77 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.16 
 
 
343 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
332 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
313 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  43.43 
 
 
331 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  42.54 
 
 
343 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  43.3 
 
 
341 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  41.99 
 
 
325 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
331 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  44.72 
 
 
328 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  40 
 
 
315 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
317 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  41.95 
 
 
349 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  44.37 
 
 
332 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  40.82 
 
 
332 aa  225  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  43.89 
 
 
329 aa  225  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  41.47 
 
 
315 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
335 aa  225  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
348 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  41.41 
 
 
334 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  45.97 
 
 
352 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
352 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
324 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  39.66 
 
 
323 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.75 
 
 
336 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
343 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
343 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.54 
 
 
353 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  44.66 
 
 
353 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
335 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
326 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
338 aa  222  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
345 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
341 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
350 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.03 
 
 
343 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  41.35 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.44 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  41.02 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  43.08 
 
 
354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  41.85 
 
 
321 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  41.12 
 
 
352 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
325 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  40 
 
 
349 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  40.6 
 
 
351 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  40.6 
 
 
351 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  41.18 
 
 
329 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1976  aldo/keto reductase  43.43 
 
 
323 aa  219  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2469  aldo/keto reductase  40.44 
 
 
348 aa  218  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
357 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
344 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.5 
 
 
339 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
370 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
339 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.5 
 
 
339 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4803  aldo/keto reductase  42.38 
 
 
329 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  39.42 
 
 
326 aa  217  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
341 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>